CLIP4

CLIP4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2Z0W
Ідентифікатори
Символи	CLIP4, RSNL2, CAP-Gly domain containing linker protein family member 4
Зовнішні ІД	MGI: 1919100 HomoloGene: 11662 GeneCards: CLIP4
Реагує на сполуку
Viroporin 3a
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	79745	78785
Ensembl	ENSG00000115295	ENSMUSG00000024059
UniProt	Q8N3C7	Q8CI96
RefSeq (мРНК)	NM_001287527 NM_001287528 NM_024692	NM_001271483 NM_001271484 NM_030179 NM_175378
RefSeq (білок)	NP_001274456 NP_001274457 NP_078968	NP_001258412 NP_001258413 NP_084455 NP_780587
Локус (UCSC)	Хр. 2: 29.1 – 29.2 Mb	Хр. 17: 72.08 – 72.17 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CLIP4 (англ. CAP-Gly domain containing linker protein family member 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 2-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 705 амінокислот, а молекулярна маса — 76 317.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTIEDLPDFP		LEGNPLFGRY		PFIFSASDTP		VIFSISAAPM		PSDCEFSFFD
PNDASCQEIL		FDPKTSVSEL		FAILRQWVPQ		VQQNIDIIGN		EILKRGCNVN
DRDGLTDMTL		LHYTCKSGAH		GIGDVETAVK		FATQLIDLGA		DISLRSRWTN
MNALHYAAYF		DVPELIRVIL		KTSKPKDVDA		TCSDFNFGTA		LHIAAYNLCA
GAVKCLLEQG		ANPAFRNDKG		QIPADVVPDP		VDMPLEMADA		AATAKEIKQM
LLDAVPLSCN		ISKAMLPNYD		HVTGKAMLTS		LGLKLGDRVV		IAGQKVGTLR
FCGTTEFASG		QWAGIELDEP		EGKNNGSVGK		VQYFKCAPKY		GIFAPLSKIS
KAKGRRKNIT		HTPSTKAAVP		LIRSQKIDVA		HVTSKVNTGL		MTSKKDSASE
STLSLPPGEE		LKTVTEKDVA		LLGSVSSCSS		TSSLEHRQSY		PKKQNAISSN
KKTMSKSPSL		SSRASAGLNS		SATSTANNSR		CEGELRLGER		VLVVGQRLGT
IRFFGTTNFA		PGYWYGIELE		KPHGKNDGSV		GGVQYFSCSP		RYGIFAPPSR
VQRVTDSLDT		LSEISSNKQN		HSYPGFRRSF		STTSASSQKE		INRRNAFSKS
KAALRRSWSS		TPTAGGIEGS		VKLHEGSQVL		LTSSNEMGTV		RYVGPTDFAS
GIWLGLELRS		AKGKNDGSVG		DKRYFTCKPN		HGVLVRPSRV		TYRGINGSKL
VDENC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 2