DCST1

DCST1
Ідентифікатори
Символи	DCST1, DC-STAMP domain containing 1, SNKY, SPE49
Зовнішні ІД	MGI: 1925022 HomoloGene: 14981 GeneCards: DCST1
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity • transferase activity Клітинна компонента • мембрана • integral component of membrane • клітинна мембрана Біологічний процес • negative regulation of type I interferon-mediated signaling pathway • процес імунної системи • Убіквітин-залежний протеоліз • вроджений імунітет • ubiquitin-dependent protein catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	149095	77772
Ensembl	ENSG00000163357	ENSMUSG00000042672
UniProt	Q5T197	Q059Y8
RefSeq (мРНК)	NM_152494 NM_001143687	NM_029974
RefSeq (білок)	NP_001137159 NP_689707	NP_084250
Локус (UCSC)	Хр. 1: 155.03 – 155.05 Mb	Хр. 3: 89.26 – 89.27 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DCST1 (англ. DC-STAMP domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 706 амінокислот, а молекулярна маса — 80 712.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDIKHHQNGT		RGQRRKQPHT		TVQRLLTWGL		PVSCSWFLWR		QPGEFPVTAL
LLGAGAGGLL		AIGLFQLLVN		PMNIYEEQKI		MFLYSLVGLG		AMGWGTSPHI
RCASLLLVPK		MLGKEGRLFV		LGYALAAIYV		GPVANLRHNL		NNVIASLGCT
VELQINNTRA		AWRISTAPLR		AMFKDLLSSK		ELLRAETRNI		SATFEDLDAQ
VNSETGYTPE		DTMDSGETAQ		GREARQAPAS		RLHLSTQKMY		ELKTKLRCSY
VVNQAILSCR		RWFDRKHEQC		MKHIWVPLLT		HLLCLPMKFK		FFCGIAKVME
VWCRNRIPVE		GNFGQTYDSL		NQSIRGLDGE		FSANIDFKEE		KQAGVLGLNT
SWERVSTEVR		DYVYRQEARL		EWALGLLHVL		LSCTFLLVLH		ASFSYMDSYN
HDIRFDNIYI		STYFCQIDDR		RKKLGKRTLL		PLRKAEEKTV		IFPCKPTIQA
SEMSNVVREL		LETLPILLLL		VVLCGLDWAL		YSIFDTIRHH		SFLQYSFRSS
HKLEVKVGGD		SMLARLLRKT		IGALNTSSET		VMESNNMPCL		PQPVGLDARA
YWRAAVPIGL		LVCLCLLQAF		GYRLRRVIAA		FYFPKREKKR		ILFLYNDLLK
KRAAFTKLRR		AAILRRERQQ		KAPRHPLADI		LHRGCPLLRR		WLCRRCVVCQ
APETPESYVC		RTLDCEAVYC		WSCWDDMRQR		CPVCTPREEL		SSSAFSDSND
DTAYAG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1