DEF8

DEF8
Ідентифікатори
Символи	DEF8, differentially expressed in FDCP 8 homolog
Зовнішні ІД	MGI: 1346331 HomoloGene: 14279 GeneCards: DEF8
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу Клітинна компонента • внутрішньоклітинний Біологічний процес • GO:0007243 intracellular signal transduction • lysosome localization • positive regulation of bone resorption • positive regulation of ruffle assembly Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54849	23854
Ensembl	ENSG00000140995	ENSMUSG00000001482
UniProt	Q6ZN54	Q99J78
RefSeq (мРНК)	NM_001242816 NM_001242817 NM_001242818 NM_001242819 NM_001242820 NM_001242821 NM_001242822 NM_017702 NM_207514	NM_001253783 NM_001253784 NM_001281803 NM_054046
RefSeq (білок)	NP_001229745 NP_001229746 NP_001229747 NP_001229748 NP_001229749 NP_001229750 NP_001229751 NP_060172 NP_997397	NP_001240712 NP_001240713 NP_001268732 NP_473387
Локус (UCSC)	Хр. 16: 89.95 – 89.97 Mb	Хр. 8: 124.15 – 124.19 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

DEF8 (англ. Differentially expressed in FDCP 8 homolog) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 16-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 512 амінокислот, а молекулярна маса — 58 710.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAILSLRAPG		PWQAMQVWAD		RTLLTPHTGV		TSQVLGVAAA		VMTPLPGGHA
AGRTREARWD		AMEYDEKLAR		FRQAHLNPFN		KQSGPRQHEQ		GPGEEVPDVT
PEEALPELPP		GEPEFRCPER		VMDLGLSEDH		FSRPVGLFLA		SDVQQLRQAI
EECKQVILEL		PEQSEKQKDA		VVRLIHLRLK		LQELKDPNED		EPNIRVLLEH
RFYKEKSKSV		KQTCDKCNTI		IWGLIQTWYT		CTGCYYRCHS		KCLNLISKPC
VSSKVSHQAE		YELNICPETG		LDSQDYRCAE		CRAPISLRGV		PSEARQCDYT
GQYYCSHCHW		NDLAVIPARV		VHNWDFEPRK		VSRCSMRYLA		LMVSRPVLRL
REINPLLFSY		VEELVEIRKL		RQDILLMKPY		FITCREAMEA		RLLLQLQDRQ
HFVENDEMYS		VQDLLDVHAG		RLGCSLTEIH		TLFAKHIKLD		CERCQAKGFV
CELCREGDVL		FPFDSHTSVC		ADCSAVFHRD		CYYDNSTTCP		KCARLSLRKQ
SLFQEPGPDV		EA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 16