DEFA1B

DEFA1B
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 2KHT, 2PM1, 3GNY, 3H6C, 3HJ2, 3HJD, 3LO1, 3LO2, 3LO4, 3LO6, 3LO9, 3LOE, 3LVX, 4DU0, 4LB1, 4LB7, 4LBB, 4LBF
Ідентифікатори
Символи	DEFA1B, HNP-1, HP-1, HP1, defensin alpha 1B
Зовнішні ІД	HomoloGene: 128756 GeneCards: DEFA1B
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	728358	н/д
Ensembl	ENSG00000240247 ENSG00000285176	н/д
UniProt	P59665	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001302265 NM_001042500	н/д
RefSeq (білок)	NP_001035965 NP_001289194	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 8: 7 – 7 Mb	н/д
PubMed search		н/д
Вікідані
Див./Ред. для людей

DEFA1B (англ. Defensin alpha 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 94 амінокислот, а молекулярна маса — 10 201.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRTLAILAAI		LLVALQAQAE		PLQARADEVA		AAPEQIAADI		PEVVVSLAWD
ESLAPKHPGS		RKNMACYCRI		PACIAGERRY		GTCIYQGRLW		AFCC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до антибіотиків, антимікробних білків, фунгіцидів, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як противірусний захист. Секретований назовні.

Література

• Daher K.A., Lehrer R.I., Ganz T., Kronenberg M. (1988). Isolation and characterization of human defensin cDNA clones. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 85: 7327—7331. PMID 3174637 DOI:10.1073/pnas.85.19.7327
• Linzmeier R., Michaelson D., Liu L., Ganz T. (1993). The structure of neutrophil defensin genes. FEBS Lett. 321: 267—273. PMID 8477861 DOI:10.1016/0014-5793(93)80122-B
• Linzmeier R., Michaelson D., Liu L., Ganz T. (1993). FEBS Lett. 326: 299—300. {{cite journal}}: Пропущений або порожній |title= (довідка) PMID 8325384 DOI:10.1016/0014-5793(93)81813-F
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Selsted M.E., Harwig S.S.L., Ganz T., Schilling J.W., Lehrer R.I. (1985). Primary structures of three human neutrophil defensins. J. Clin. Invest. 76: 1436—1439. PMID 4056036 DOI:10.1172/JCI112121
• Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504

Див. також

• Хромосома 8