EFCAB5

EFCAB5
Ідентифікатори
Символи	EFCAB5, EF-hand calcium binding domain 5
Зовнішні ІД	MGI: 2442440 HomoloGene: 63366 GeneCards: EFCAB5
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	374786	319634
Ensembl	ENSG00000176927	ENSMUSG00000050944
UniProt	A4FU69	A0JP43
RefSeq (мРНК)	NM_001033562 NM_001145053 NM_198529	NM_176965
RefSeq (білок)	NP_001138525 NP_940931	NP_795939
Локус (UCSC)	Хр. 17: 29.93 – 30.11 Mb	Хр. 11: 77.09 – 77.19 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

EFCAB5 (англ. EF-hand calcium binding domain 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 17-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 503 амінокислот, а молекулярна маса — 173 404.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MNESASQEEL		RPAQENRKED		KERKWNLTEV		KELHETLQSV		PDVPVKEDTN
SVVEKAMDEI		KSQELNLEGQ		RKISPGSIKD		SKTEASGNIA		IRKSAKVIFA
LDETELKSKP		EHTWKKNLFE		RMEARAQAMQ		QKIIDKENLK		KELEKKAEKK
LPRDNLAKEW		FNTDSMTLNN		TAYLLDKLLP		TLVPGVENML		TQVEKKKVLT
EADTPSKFDP		INYLGEYLIR		NNPNYIKDPG		MSGYQRLMKE		VTEDLKIYVP
DTICNRVSKM		KENVKQNRKQ		RESIDKIIVK		VANTRKQALQ		EQFDEWILDP
KGMIPKSVIQ		NVLQEFFQNP		DFKLGSHCKQ		LDITDSTEPR		LNKMEFTEYI
SSHIKDLKSE		MFEELLKHLC		HSADEFREVI		KADMRRQMFA		ELFLHCDHGK
VGFLDRQRTL		ALLELFYDHS		SQMLRSLLRN		PRQWPFIEFE		EINLTELWGD
MDNQKHIYEG		FDKVLLEMNT		LLSANHASKT		QSKLLESPDQ		PKLNEQRTST
PSPNPPEQQR		GVTAEQGPQR		ISIEEQQQGK		KPTAEQELYI		ESVIEPGTHT
ESTLEQGSSR		RLLTEQETHR		ESTTEQGQHK		GSIEGQGPRR		VSVSEQGSSR
ESVAEQGSRR		ESIAEQDRHK		GSVAEQGSRR		MSAAEQGSLR		ESVIEEPYQK
SEQGPYGEII		SEEQEDIGST		SQSRKDSILK		STKYGEPITS		EYIEVPLQEK
RSWEQTYEEE		IFLSSELQEE		VPTLSRKDHF		PETTKKEVQK		DKPCEPKSQK
IEGKSWSGEF		FTCNWKMKYV		TFEDEEQANL		IYGNSRFTDL		HSIIRNIQSC
KEVKGRTAFN		GVSFNLLQFV		QLLETFVGED		APLSVSETLT		SFFKEGYVET
EQEKMNALEQ		FSQNAFQVRQ		RLLLEAIFQK		WDSDGSGFLD		LKEVDELLYT
YKEGMEKESM		KKAKLHIQFP		KPHPGHEVRL		SSKQFQNYIE		LVVSELRGNE
DQVLESVVEF		LMNALERSHI		ESLRNSARRK		WLHQIQCAAE		TSGVSLEPVY
SETFKALMQD		AEAHGNKKIS		AHISLLEENL		LLPEKGNVLL		RNVACTLDDA
QFVLNRVLYR		DMKGISFTVV		DEGKPIHVPQ		VQYHGNIFFW		NQSRNKHDYN
GSFLALPLQD		AYMRIFGVLA		VDTLRDPHEI		NIFLPHEIRF		YQGVANVFST
AYHYVHSREH		ILHIVITGIG		WLYDVTSSIT		SITTYFVEPS		PAQDSDYVLR
NMMVTGQLGL		TEIHKNPPTI		HRKSCIFRDF		LFKCTDSSEV		VLASACGETH
IVVPLRERTG		EALGVLDFNI		GQNRMLLCQE		YKDLQKMMKV		VQVACYEILG
EFSGEIKKKY		ILEIENVREV		QRAGILFFRI		MLLELQESIQ		LLNSMEFVSL
LLYDHTLVTE		PNSPQDSKSM		ELEANVKLVR		DILKAVILFF		HPELEFSSDF
GSWDKCKFYV		NKYLVNNICA		FDPTAKHVEV		NVQLIDEYIR		DHSRTEVWKF
GNVVIEHLYH		WIHICSALMK		ITKQLNSGIT		PPLPSKTDNY		MYAKMPGEGL
QEK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 17