EXD1

EXD1
Ідентифікатори
Символи	EXD1, EXDL1, exonuclease 3'-5' domain containing 1
Зовнішні ІД	MGI: 3045306 HomoloGene: 17627 GeneCards: EXD1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein homodimerization activity • 3'-5' exonuclease activity • RNA binding • nucleic acid binding Клітинна компонента • цитоплазма • P granule • PET complex Біологічний процес • Сайленсинг генів • GO:0007126 мейоз • nucleobase-containing compound metabolic process • piRNA metabolic process • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	161829	241624
Ensembl	ENSG00000178997	ENSMUSG00000048647
UniProt	Q8NHP7	Q8CDF7
RefSeq (мРНК)	NM_001286441 NM_152596 NM_001385036	NM_172857
RefSeq (білок)	NP_001273370 NP_689809	NP_766445 NP_001394746
Локус (UCSC)	Хр. 15: 41.18 – 41.23 Mb	Хр. 2: 119.35 – 119.38 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

EXD1 (англ. Exonuclease 3'-5' domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 15-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 514 амінокислот, а молекулярна маса — 58 335.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEDSEFLAYV		ELLDEVEQGS		VRAKASSVSL		HAERTWMEKM		KVEDLNVCEP
ASPAPEAPAT		SLLNDLKYSP		SEEEEVTYTV		INQFQQKFGA		AILHIKKQNV
LSVAAEGANV		CRHGKLCWLQ		VATNCRVYLF		DIFLLGSRAF		HNGLQMILED
KRILKVIHDC		RWLSDCLSHQ		YGILLNNVFD		TQVADVLQFS		METGGYLPNC
ITTLQESLIK		HLQVAPKYLS		FLEKRQKLIQ		ENPEVWFIRP		VSPSLLKILA
LEATYLLPLR		LALLDEMMSD		LTTLVDGYLN		TYREGSADRL		GGTEPTCMEL
PEELLQLKDF		QKQRREKAAR		EYRVNAQGLL		IRTVLQPKKL		VTETAGKEEK
VKGFLFGKNF		RIDKAPSFTS		QDFHGDVNLL		KEESLNKQAT		NPQHLPPTEE
GETSEDSSNK		LICTKSKGSE		DQRITQKEHF		MTPKHEFQAS		LSLKEETEQL
LMVENKEDLK		CTKQAVSMSS		FPQETRVSPS		DTFYPIRKTV		VSTLPPCPAL
EKIDSWISPF		LNLP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах, як РНК-залежне заглушення генів, мейоз, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 15