GCN1

GCN1
Ідентифікатори
Символи	GCN1, GCN1L, PRIC295, GCN1L1, eIF2 alpha kinase activator homolog, GCN1 activator of EIF2AK4
Зовнішні ІД	OMIM: 605614 MGI: 2444248 HomoloGene: 5887 GeneCards: GCN1
Онтологія гена Молекулярна функція • ribosome binding • translation factor activity, RNA binding • protein kinase binding • protein kinase regulator activity • RNA binding • cadherin binding Клітинна компонента • Полісома • рибосома • мембрана • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to stress • positive regulation of kinase activity • cellular response to stress • cellular response to amino acid starvation • regulation of protein kinase activity • cellular response to leucine starvation • regulation of translation • Біосинтез білків Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10985	231659
Ensembl	ENSG00000089154	ENSMUSG00000041638
UniProt	Q92616	E9PVA8
RefSeq (мРНК)	NM_006836	NM_172719
RefSeq (білок)	NP_006827	NP_766307
Локус (UCSC)	Хр. 12: 120.13 – 120.19 Mb	Хр. 5: 115.7 – 115.76 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

GCN1 (англ. GCN1, eIF2 alpha kinase activator homolog) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 671 амінокислот, а молекулярна маса — 292 758.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAADTQVSET		LKRFAGKVTT		ASVKERREIL		SELGKCVAGK		DLPEGAVKGL
CKLFCLTLHR		YRDAASRRAL		QAAIQQLAEA		QPEATAKNLL		HSLQSSGIGS
KAGVPSKSSG		SAALLALTWT		CLLVRIVFPS		RAKRQGDIWN		KLVEVQCLLL
LEVLGGSHKH		AVDGAVKKLT		KLWKENPGLV		EQYLSAILSL		EPNQNYAGML
GLLVQFCTSH		KEMDVVSQHK		SALLDFYMKN		ILMSKVKPPK		YLLDSCAPLL
RYLSHSEFKD		LILPTIQKSL		LRSPENVIET		ISSLLASVTL		DLSQYAMDIV
KGLAGHLKSN		SPRLMDEAVL		ALRNLARQCS		DSSAMESLTK		HLFAILGGSE
GKLTVVAQKM		SVLSGIGSVS		HHVVSGPSSQ		VLNGIVAELF		IPFLQQEVHE
GTLVHAVSVL		ALWCNRFTME		VPKKLTEWFK		KAFSLKTSTS		AVRHAYLQCM
LASYRGDTLL		QALDLLPLLI		QTVEKAASQS		TQVPTITEGV		AAALLLLKLS
VADSQAEAKL		SSFWQLIVDE		KKQVFTSEKF		LVMASEDALC		TVLHLTERLF
LDHPHRLTGN		KVQQYHRALV		AVLLSRTWHV		RRQAQQTVRK		LLSSLGGFKL
AHGLLEELKT		VLSSHKVLPL		EALVTDAGEV		TEAGKAYVPP		RVLQEALCVI
SGVPGLKGDV		TDTEQLAQEM		LIISHHPSLV		AVQSGLWPAL		LARMKIDPEA
FITRHLDQII		PRMTTQSPLN		QSSMNAMGSL		SVLSPDRVLP		QLISTITASV
QNPALRLVTR		EEFAIMQTPA		GELYDKSIIQ		SAQQDSIKKA		NMKRENKAYS
FKEQIIELEL		KEEIKKKKGI		KEEVQLTSKQ		KEMLQAQLDR		EAQVRRRLQE
LDGELEAALG		LLDIILAKNP		SGLTQYIPVL		VDSFLPLLKS		PLAAPRIKNP
FLSLAACVMP		SRLKALGTLV		SHVTLRLLKP		ECVLDKSWCQ		EELSVAVKRA
VMLLHTHTIT		SRVGKGEPGA		APLSAPAFSL		VFPFLKMVLT		EMPHHSEEEE
EWMAQILQIL		TVQAQLRASP		NTPPGRVDEN		GPELLPRVAM		LRLLTWVIGT
GSPRLQVLAS		DTLTTLCASS		SGDDGCAFAE		QEEVDVLLCA		LQSPCASVRE
TVLRGLMELH		MVLPAPDTDE		KNGLNLLRRL		WVVKFDKEEE		IRKLAERLWS
MMGLDLQPDL		CSLLIDDVIY		HEAAVRQAGA		EALSQAVARY		QRQAAEVMGR
LMEIYQEKLY		RPPPVLDALG		RVISESPPDQ		WEARCGLALA		LNKLSQYLDS
SQVKPLFQFF		VPDALNDRHP		DVRKCMLDAA		LATLNTHGKE		NVNSLLPVFE
EFLKNAPNDA		SYDAVRQSVV		VLMGSLAKHL		DKSDPKVKPI		VAKLIAALST
PSQQVQESVA		SCLPPLVPAI		KEDAGGMIQR		LMQQLLESDK		YAERKGAAYG
LAGLVKGLGI		LSLKQQEMMA		ALTDAIQDKK		NFRRREGALF		AFEMLCTMLG
KLFEPYVVHV		LPHLLLCFGD		GNQYVREAAD		DCAKAVMSNL		SAHGVKLVLP
SLLAALEEES		WRTKAGSVEL		LGAMAYCAPK		QLSSCLPNIV		PKLTEVLTDS
HVKVQKAGQQ		ALRQIGSVIR		NPEILAIAPV		LLDALTDPSR		KTQKCLQTLL
DTKFVHFIDA		PSLALIMPIV		QRAFQDRSTD		TRKMAAQIIG		NMYSLTDQKD
LAPYLPSVTP		GLKASLLDPV		PEVRTVSAKA		LGAMVKGMGE		SCFEDLLPWL
METLTYEQSS		VDRSGAAQGL		AEVMAGLGVE		KLEKLMPEIV		ATASKVDIAP
HVRDGYIMMF		NYLPITFGDK		FTPYVGPIIP		CILKALADEN		EFVRDTALRA
GQRVISMYAE		TAIALLLPQL		EQGLFDDLWR		IRFSSVQLLG		DLLFHISGVT
GKMTTETASE		DDNFGTAQSN		KAIITALGVE		RRNRVLAGLY		MGRSDTQLVV
RQASLHVWKI		VVSNTPRTLR		EILPTLFGLL		LGFLASTCAD		KRTIAARTLG
DLVRKLGEKI		LPEIIPILEE		GLRSQKSDER		QGVCIGLSEI		MKSTSRDAVL
YFSESLVPTA		RKALCDPLEE		VREAAAKTFE		QLHSTIGHQA		LEDILPFLLK
QLDDEEVSEF		ALDGLKQVMA		IKSRVVLPYL		VPKLTTPPVN		TRVLAFLSSV
AGDALTRHLG		VILPAVMLAL		KEKLGTPDEQ		LEMANCQAVI		LSVEDDTGHR
IIIEYLLEAT		RSPEVGMRQA		AAIILNIYCS		RSKADYTSHL		RSLVSGLIRL
FNDSSPVVLE		ESWDALNAIT		KKLDAGNQLA		LIEELHKEIR		LIGNESKGEH
VPGFCLPKKG		VTSILPVLRE		GVLTGSPEQK		EEAAKALGLV		IRLTSADALR
PSVVSITGPL		IRILGDRFSW		NVKAALLETL		SLLLAKVGIA		LKPFLPQLQT
TFTKALQDSN		RGVRLKAADA		LGKLISIHIK		VDPLFTELLN		GIRAMEDPGV
RDTMLQALRF		VIQGAGAKVD		AVIRKNIVSL		LLSMLGHDED		NTRISSAGCL
GELCAFLTEE		ELSAVLQQCL		LADVSGIDWM		VRHGRSLALS		VAVNVAPGRL
CAGRYSSDVQ		EMILSSATAD		RIPIAVSGVR		GMGFLMRHHI		ETGGGQLPAK
LSSLFVKCLQ		NPSSDIRLVA		EKMIWWANKD		PLPPLDPQAI		KPILKALLDN
TKDKNTVVRA		YSDQAIVNLL		KMRQGEEVFQ		SLSKILDVAS		LEVLNEVNRR
SLKKLASQAD		STEQVDDTIL		T

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах як регуляція трансляції, відповідь на стрес. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Marton M.J., Vazquez de Aldana C.R., Qiu H., Chakraburtty K., Hinnebusch A.G. (1997). Evidence that GCN1 and GCN20, translational regulators of GCN4, function on elongating ribosomes in activation of eIF2alpha kinase GCN2. Mol. Cell. Biol. 17: 4474—4489. PMID 9234705 DOI:10.1128/MCB.17.8.4474

Див. також

• Хромосома 12