HDDC2

HDDC2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4DMB, 4L1J, 4L7E, 4L7W
Ідентифікатори
Символи	HDDC2, C6orf74, NS5ATP2, dJ167O5.2, CGI-130, HD domain containing 2
Зовнішні ІД	MGI: 1916942 HomoloGene: 5431 GeneCards: HDDC2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • 5'-deoxynucleotidase activity Клітинна компонента • екзосома • мітохондрія Біологічний процес • GO:0098501, GO:0098502, GO:0006286 дефосфорилювання • dUMP biosynthetic process • pyrimidine deoxyribonucleotide salvage Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51020	69692
Ensembl	ENSG00000111906	ENSMUSG00000000295
UniProt	Q7Z4H3	Q3SXD3
RefSeq (мРНК)	NM_016063	NM_027168
RefSeq (білок)	NP_057147	NP_081444
Локус (UCSC)	Хр. 6: 125.22 – 125.3 Mb	Хр. 10: 31.31 – 31.33 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HDDC2 (англ. HD domain containing 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 6-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 204 амінокислот, а молекулярна маса — 23 390.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MASVSSATFS		GHGARSLLQF		LRLVGQLKRV		PRTGWVYRNV		QRPESVSDHM
YRMAVMAMVI		KDDRLNKDRC		VRLALVHDMA		ECIVGDIAPA		DNIPKEEKHR
REEEAMKQIT		QLLPEDLRKE		LYELWEEYET		QSSAEAKFVK		QLDQCEMILQ
ASEYEDLEHK		PGRLQDFYDS		TAGKFNHPEI		VQLVSELEAE		RSTNIAAAAS
EPHS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг.

Література

• Lai C.-H., Chou C.-Y., Ch'ang L.-Y., Liu C.-S., Lin W.-C. (2000). Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics. Genome Res. 10: 703—713. PMID 10810093 DOI:10.1101/gr.10.5.703
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 6