HECTD1

HECTD1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2DK3, 2LC3, 3DKM
Ідентифікатори
Символи	HECTD1, EULIR, HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 1
Зовнішні ІД	MGI: 2384768 HomoloGene: 9115 GeneCards: HECTD1
Реагує на сполуку
Viroporin 3a
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • transferase activity • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity • GO:1904264, GO:1904822, GO:0090622, GO:0090302 ubiquitin protein ligase activity Клітинна компонента • цитоплазма Біологічний процес • Убіквітин-залежний протеоліз • protein K63-linked ubiquitination • heart valve development • ventricular septum development • aorta development Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	25831	207304
Ensembl	ENSG00000092148	ENSMUSG00000035247
UniProt	Q9ULT8	F8WIE5
RefSeq (мРНК)	NM_015382	NM_144788
RefSeq (білок)	NP_056197	NP_659037 NP_001392110 NP_001392111 NP_001392112 NP_001392113 NP_001392114 NP_001392115 NP_001392116
Локус (UCSC)	Хр. 14: 31.1 – 31.21 Mb	Хр. 12: 51.74 – 51.83 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HECTD1 (англ. HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 14-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 610 амінокислот, а молекулярна маса — 289 384.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MADVDPDTLL		EWLQMGQGDE		RDMQLIALEQ		LCMLLLMSDN		VDRCFETCPP
RTFLPALCKI		FLDESAPDNV		LEVTARAITY		YLDVSAECTR		RIVGVDGAIK
ALCNRLVVVE		LNNRTSRDLA		EQCVKVLELI		CTRESGAVFE		AGGLNCVLTF
IRDSGHLVHK		DTLHSAMAVV		SRLCGKMEPQ		DSSLEICVES		LSSLLKHEDH
QVSDGALRCF		ASLADRFTRR		GVDPAPLAKH		GLTEELLSRM		AAAGGTVSGP
SSACKPGRST		TGAPSTTADS		KLSNQVSTIV		SLLSTLCRGS		PVVTHDLLRS
ELPDSIESAL		QGDERCVLDT		MRLVDLLLVL		LFEGRKALPK		SSAGSTGRIP
GLRRLDSSGE		RSHRQLIDCI		RSKDTDALID		AIDTGAFEVN		FMDDVGQTLL
NWASAFGTQE		MVEFLCERGA		DVNRGQRSSS		LHYAACFGRP		QVAKTLLRHG
ANPDLRDEDG		KTPLDKARER		GHSEVVAILQ		SPGDWMCPVN		KGDDKKKKDT
NKDEEECNEP		KGDPEMAPIY		LKRLLPVFAQ		TFQQTMLPSI		RKASLALIRK
MIHFCSEALL		KEVCDSDVGH		NLPTILVEIT		ATVLDQEDDD		DGHLLALQII
RDLVDKGGDI		FLDQLARLGV		ISKVSTLAGP		SSDDENEEES		KPEKEDEPQE
DAKELQQGKP		YHWRDWSIIR		GRDCLYIWSD		AAALELSNGS		NGWFRFILDG
KLATMYSSGS		PEGGSDSSES		RSEFLEKLQR		ARGQVKPSTS		SQPILSAPGP
TKLTVGNWSL		TCLKEGEIAI		HNSDGQQATI		LKEDLPGFVF		ESNRGTKHSF
TAETSLGSEF		VTGWTGKRGR		KLKSKLEKTK		QKVRTMARDL		YDDHFKAVES
MPRGVVVTLR		NIATQLESSW		ELHTNRQCIE		SENTWRDLMK		TALENLIVLL
KDENTISPYE		MCSSGLVQAL		LTVLNNSMDL		DMKQDCSQLV		ERINVFKTAF
SENEDDESRP		AVALIRKLIA		VLESIERLPL		HLYDTPGSTY		NLQILTRRLR
FRLERAPGET		ALIDRTGRML		KMEPLATVES		LEQYLLKMVA		KQWYDFDRSS
FVFVRKLREG		QNFIFRHQHD		FDENGIIYWI		GTNAKTAYEW		VNPAAYGLVV
VTSSEGRNLP		YGRLEDILSR		DNSALNCHSN		DDKNAWFAID		LGLWVIPSAY
TLRHARGYGR		SALRNWVFQV		SKDGQNWTSL		YTHVDDCSLN		EPGSTATWPL
DPPKDEKQGW		RHVRIKQMGK		NASGQTHYLS		LSGFELYGTV		NGVCEDQLGK
AAKEAEANLR		RQRRLVRSQV		LKYMVPGARV		IRGLDWKWRD		QDGSPQGEGT
VTGELHNGWI		DVTWDAGGSN		SYRMGAEGKF		DLKLAPGYDP		DTVASPKPVS
STVSGTTQSW		SSLVKNNCPD		KTSAAAGSSS		RKGSSSSVCS		VASSSDISLG
STKTERRSEI		VMEHSIVSGA		DVHEPIVVLS		SAENVPQTEV		GSSSSASTST
LTAETGSENA		ERKLGPDSSV		RTPGESSAIS		MGIVSVSSPD		VSSVSELTNK
EAASQRPLSS		SASNRLSVSS		LLAAGAPMSS		SASVPNLSSR		ETSSLESFVR
RVANIARTNA		TNNMNLSRSS		SDNNTNTLGR		NVMSTATSPL		MGAQSFPNLT
TPGTTSTVTM		STSSVTSSSN		VATATTVLSV		GQSLSNTLTT		SLTSTSSESD
TGQEAEYSLY		DFLDSCRAST		LLAELDDDED		LPEPDEEDDE		NEDDNQEDQE
YEEVMILRRP		SLQRRAGSRS		DVTHHAVTSQ		LPQVPAGAGS		RPIGEQEEEE
YETKGGRRRT		WDDDYVLKRQ		FSALVPAFDP		RPGRTNVQQT		TDLEIPPPGT
PHSELLEEVE		CTPSPRLALT		LKVTGLGTTR		EVELPLTNFR		STIFYYVQKL
LQLSCNGNVK		SDKLRRIWEP		TYTIMYREMK		DSDKEKENGK		MGCWSIEHVE
QYLGTDELPK		NDLITYLQKN		ADAAFLRHWK		LTGTNKSIRK		NRNCSQLIAA
YKDFCEHGTK		SGLNQGAIST		LQSSDILNLT		KEQPQAKAGN		GQNSCGVEDV
LQLLRILYIV		ASDPYSRISQ		EDGDEQLQFT		FPPDEFTSKK		ITTKILQQIE
EPLALASGAL		PDWCEQLTSK		CPFLIPFETR		QLYFTCTAFG		ASRAIVWLQN
RREATVERTR		TTSSVRRDDP		GEFRVGRLKH		ERVKVPRGES		LMEWAENVMQ
IHADRKSVLE		VEFLGEEGTG		LGPTLEFYAL		VAAEFQRTDL		GAWLCDDNFP
DDESRHVDLG		GGLKPPGYYV		QRSCGLFTAP		FPQDSDELER		ITKLFHFLGI
FLAKCIQDNR		LVDLPISKPF		FKLMCMGDIK		SNMSKLIYES		RGDRDLHCTE
SQSEASTEEG		HDSLSVGSFE		EDSKSEFILD		PPKPKPPAWF		NGILTWEDFE
LVNPHRARFL		KEIKDLAIKR		RQILSNKGLS		EDEKNTKLQE		LVLKNPSGSG
PPLSIEDLGL		NFQFCPSSRI		YGFTAVDLKP		SGEDEMITMD		NAEEYVDLMF
DFCMHTGIQK		QMEAFRDGFN		KVFPMEKLSS		FSHEEVQMIL		CGNQSPSWAA
EDIINYTEPK		LGYTRDSPGF		LRFVRVLCGM		SSDERKAFLQ		FTTGCSTLPP
GGLANLHPRL		TVVRKVDATD		ASYPSVNTCV		HYLKLPEYSS		EEIMRERLLA
ATMEKGFHLN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як убіквітинування білків.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Nakayama M., Kikuno R., Ohara O. (2002). Protein-protein interactions between large proteins: two-hybrid screening using a functionally classified library composed of long cDNAs. Genome Res. 12: 1773—1784. PMID 12421765 DOI:10.1101/gr.406902

Див. також

• Хромосома 14