HOMER3

HOMER3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2P8V, 3CVF
Ідентифікатори
Символи	HOMER3, HOMER-3, VESL3, homer scaffolding protein 3, homer scaffold protein 3
Зовнішні ІД	OMIM: 604800 MGI: 1347359 HomoloGene: 37972 GeneCards: HOMER3
Онтологія гена Молекулярна функція • protein C-terminus binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein domain specific binding • G protein-coupled glutamate receptor binding • identical protein binding Клітинна компонента • basal part of cell • міжклітинні контакти • postsynaptic membrane • синапс • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • мембрана • цитоплазма • гіалоплазма • клітинна мембрана • компонент клітини • glutamatergic synapse • дендрит (нейробіологія) • neuron projection Біологічний процес • G protein-coupled glutamate receptor signaling pathway • сортування білків • negative regulation of interleukin-2 production • negative regulation of calcineurin-NFAT signaling cascade • regulation of postsynaptic neurotransmitter receptor activity • regulation of store-operated calcium entry Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	9454	26558
Ensembl	ENSG00000051128	ENSMUSG00000003573
UniProt	Q9NSC5	Q99JP6
RefSeq (мРНК)	NM_001145721 NM_001145722 NM_001145724 NM_004838	NM_001146153 NM_011984
RefSeq (білок)	NP_001139193 NP_001139194 NP_001139196 NP_004829 NP_001139194.1 NP_001139196.1	NP_001139625 NP_036114
Локус (UCSC)	Хр. 19: 18.93 – 18.94 Mb	Хр. 8: 70.28 – 70.29 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HOMER3 (англ. Homer scaffolding protein 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 361 амінокислот, а молекулярна маса — 39 836.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSTAREQPIF		STRAHVFQID		PATKRNWIPA		GKHALTVSYF		YDATRNVYRI
ISIGGAKAII		NSTVTPNMTF		TKTSQKFGQW		ADSRANTVYG		LGFASEQHLT
QFAEKFQEVK		EAARLAREKS		QDGGELTSPA		LGLASHQVPP		SPLVSANGPG
EEKLFRSQSA		DAPGPTERER		LKKMLSEGSV		GEVQWEAEFF		ALQDSNNKLA
GALREANAAA		AQWRQQLEAQ		RAEAERLRQR		VAELEAQAAS		EVTPTGEKEG
LGQGQSLEQL		EALVQTKDQE		IQTLKSQTGG		PREALEAAER		EETQQKVQDL
ETRNAELEHQ		LRAMERSLEE		ARAERERARA		EVGRAAQLLD		VSLFELSELR
EGLARLAEAA		P

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних контактах, синапсах.

Література

• Soloviev M., Ciruela F., Chan W.-Y., McIlhinney R.A.J. (2000). Molecular characterisation of two structurally distinct groups of human homers, generated by extensive alternative splicing. J. Mol. Biol. 295: 1185—1200. PMID 10653696 DOI:10.1006/jmbi.1999.3436
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 19