LARP1B

LARP1B
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 4ZC4, 5C0V
Ідентифікатори
Символи	LARP1B, LARP2, La ribonucleoprotein domain family member 1B, La ribonucleoprotein 1B
Зовнішні ІД	HomoloGene: 56795 GeneCards: LARP1B
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • positive regulation of mitophagy in response to mitochondrial depolarization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	55132	568156
Ensembl	ENSG00000138709	н/д
UniProt	Q659C4	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001278604 NM_018078 NM_032239 NM_178043 NM_001350531	XM_005158557 XM_009293108 XM_691468
RefSeq (білок)	NP_001265533 NP_060548 NP_115615 NP_835144 NP_001337460	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 4: 128.06 – 128.22 Mb	н/д
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LARP1B (англ. La ribonucleoprotein domain family member 1B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 4-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 914 амінокислот, а молекулярна маса — 105 322.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MENWPTPSEL		VNTGFQSVLS		QGNKKPQNRK		EKEEKVEKRS		NSDSKENRET
KLNGPGENVS		EDEAQSSNQR		KRANKHKWVP		LHLDVVRSES		QERPGSRNSS
RCQPEANKPT		HNNRRNDTRS		WKRDREKRDD		QDDVSSVRSE		GGNIRGSFRG
RGRGRGRGRG		RGRGNPRLNF		DYSYGYQEHG		ERTDQPFQTE		LNTSMMYYYD
DGTGVQVYPV		EEALLKEYIK		RQIEYYFSVE		NLERDFFLRG		KMDEQGFLPI
SLIAGFQRVQ		ALTTNLNLIL		EALKDSTEVE		IVDEKMRKKI		EPEKWPIPGP
PPRSVPPTDF		SQLIDCPEFV		PGQAFCSHTE		SAPNSPRIGS		PLSPKKNSET
SILQAMSRGL		STSLPDLDSE		PWIEVKKRHQ		PAPVKLRESV		SVPEGSLNQL
CSSEEPEQEE		LDFLFDEEIE		QIGRKNTFTD		WSDNDSDYEI		DDQDLNKILI
VTQTPPYVKK		HPGGDRTGTH		MSRAKITSEL		AKVINDGLYY		YEQDLWMEED
ENKHTAIKQE		VENFKKLNLI		SKEQFENLTP		ELPFEPNQEV		PVAPSQSRQG
GVQGVLHIPK		KDLTDELAQK		LFDVSEITSA		AMVHSLPTAV		PESPRIHPTR
TPKTPRTPRL		QDPNKTPRFY		PVVKEPKAID		VKSPRKRKTR		HSTNPPLECH
VGWVMDSRDR		GPGTSSVSTS		NASPSEGAPL		AGSYGCTPHS		FPKFQHPSHE
LLKENGFTQQ		VYHKYRRRCL		SERKRLGIGQ		SQEMNTLFRF		WSFFLRDHFN
KKMYEEFRQL		AWEDAKENYR		YGLECLFRFY		SYGLEKKFRR		EIFQDFQEET
KKDYESGQLY		GLEKFWAYLK		YSQSKTQSID		PKLQEYLCSF		KRLEDFRVDP
PISDEFGRKR		HSSTSGEESN		RHRLPPNSST		KPPNAAKPTS		TSELQVPINS
PRRNISPESS		DNSH

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 4