LARP4

LARP4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2CQK, 3PKN
Ідентифікатори
Символи	LARP4, PP13296, La ribonucleoprotein domain family member 4
Зовнішні ІД	MGI: 2443114 HomoloGene: 19173 GeneCards: LARP4
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nucleic acid binding • poly(A) binding • RNA binding Клітинна компонента • мембрана • Полісома • cytoplasmic stress granule • cytosolic small ribosomal subunit • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • regulation of cell morphogenesis • cytoskeleton organization • positive regulation of translation • Біосинтез білків Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	113251	207214
Ensembl	ENSG00000161813	ENSMUSG00000023025
UniProt	Q71RC2	Q8BWW4
RefSeq (мРНК)	NM_001170803 NM_001170804 NM_001170808 NM_052879 NM_199188 NM_199190 NM_001330415	NM_001024526 NM_001080948 NM_001284521 NM_001284522 NM_001284523
RefSeq (білок)	NP_001164274 NP_001164275 NP_001164279 NP_001317344 NP_443111 NP_954658 NP_954660 NP_001339233 NP_001339234 NP_001339235 NP_001339236 NP_001339237 NP_001339238 NP_001339239 NP_001339240 NP_001339241 NP_001339242 NP_001339243 NP_001339244 NP_001339245 NP_001339246 NP_001339247 NP_001339248 NP_001339249 NP_001339250 NP_001339251 NP_001339252 NP_001339253 NP_001339254 NP_001339255	NP_001019697 NP_001074417 NP_001271450 NP_001271451 NP_001271452
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 15: 99.87 – 99.91 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LARP4 (англ. La ribonucleoprotein domain family member 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 724 амінокислот, а молекулярна маса — 80 596.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLLFVEQVAS		KGTGLNPNAK		VWQEIAPGNT		DATPVTHGTE		SSWHEIAATS
GAHPEGNAEL		SEDICKEYEV		MYSSSCETTR		NTTGIEESTD		GMILGPEDLS
YQIYDVSGES		NSAVSTEDLK		ECLKKQLEFC		FSRENLSKDL		YLISQMDSDQ
FIPIWTVANM		EEIKKLTTDP		DLILEVLRSS		PMVQVDEKGE		KVRPSHKRCI
VILREIPETT		PIEEVKGLFK		SENCPKVISC		EFAHNSNWYI		TFQSDTDAQQ
AFKYLREEVK		TFQGKPIMAR		IKAINTFFAK		NGYRLMDSSI		YSHPIQTQAQ
YASPVFMQPV		YNPHQQYSVY		SIVPQSWSPN		PTPYFETPLA		PFPNGSFVNG
FNSPGSYKTN		AAAMNMGRPF		QKNRVKPQFR		SSGGSEHSTE		GSVSLGDGQL
NRYSSRNFPA		ERHNPTVTGH		QEQTYLQKET		STLQVEQNGD		YGRGRRTLFR
GRRRREDDRI		SRPHPSTAES		KAPTPKFDLL		ASNFPPLPGS		SSRMPGELVL
ENRMSDVVKG		VYKEKDNEEL		TISCPVPADE		QTECTSAQQL		NMSTSSPCAA
ELTALSTTQQ		EKDLIEDSSV		QKDGLNQTTI		PVSPPSTTKP		SRASTASPCN
NNINAATAVA		LQEPRKLSYA		EVCQKPPKEP		SSVLVQPLRE		LRSNVVSPTK
NEDNGAPENS		VEKPHEKPEA		RASKDYSGFR		GNIIPRGAAG		KIREQRRQFS
HRAIPQGVTR		RNGKEQYVPP		RSPK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як біосинтез білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Seetharaman S., Flemyng E., Shen J., Conte M.R., Ridley A.J. (2016). The RNA-binding protein LARP4 regulates cancer cell migration and invasion. Cytoskeleton. 73: 680—690. PMID 27615744 DOI:10.1002/cm.21336

Див. також

• Хромосома 12