LRCH3

LRCH3
Ідентифікатори
Символи	LRCH3, leucine rich repeats and calponin homology domain containing 3
Зовнішні ІД	MGI: 1917394 HomoloGene: 13111 GeneCards: LRCH3
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • extracellular region • гіалоплазма • клітинна мембрана Біологічний процес • GO:0072468 сигнальна трансдукція Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84859	70144
Ensembl	ENSG00000186001	ENSMUSG00000022801
UniProt	Q96II8	Q8BVU0
RefSeq (мРНК)	NM_032773 NM_001363887 NM_001365715 NM_001365716 NM_001365717 NM_001365718 NM_001365719	NM_001081255 NM_001310672 NM_001310673 NM_001310674
RefSeq (білок)	NP_116162 NP_001350816 NP_001352644 NP_001352645 NP_001352646 NP_001352647 NP_001352648	NP_001074724 NP_001297601 NP_001297602 NP_001297603
Локус (UCSC)	Хр. 3: 197.79 – 197.89 Mb	Хр. 16: 32.73 – 32.84 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

LRCH3 (англ. Leucine rich repeats and calponin homology domain containing 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 3-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 777 амінокислот, а молекулярна маса — 86 083.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAAAGLVAVA		AAAEYSGTVA		SGGNLPGVHC		GPSSGAGPGF		GPGSWSRSLD
RALEEAAVTG		VLSLSGRKLR		EFPRGAANHD		LTDTTRADLS		RNRLSEIPIE
ACHFVSLENL		NLYQNCIRYI		PEAILNLQAL		TFLNISRNQL		STLPVHLCNL
PLKVLIASNN		KLVSLPEEIG		HLRHLMELDV		SCNEIQTIPS		QIGNLEALRD
LNVRRNHLVH		LPEELAELPL		IRLDFSCNKI		TTIPVCYRNL		RHLQTITLDN
NPLQSPPAQI		CIKGKVHIFK		YLNIQACKIA		PDLPDYDRRP		LGFGSCHEEL
YSSRPYGALD		SGFNSVDSGD		KRWSGNEPTD		EFSDLPLRVA		EITKEQRLRR
ESQYQENRGS		LVVTNGGVEH		DLDQIDYIDS		CTAEEEEAEV		RQPKGPDPDS
LSSQFMAYIE		QRRISHEGSP		VKPVAIREFQ		KTEDMRRYLH		QNRVPAEPSS
LLSLSASHNQ		LSHTDLELHQ		RREQLVERTR		REAQLAALQY		EEEKIRTKQI
QRDAVLDFVK		QKASQSPQKQ		HPLLDGVDGE		CPFPSRRSQH		TDDSALCMSL
SGLNQVGCAA		TLPHSSAFTP		LKSDDRPNAL		LSSPATETVH		HSPAYSFPAA
IQRNQPQRPE		SFLFRAGVRA		ETNKGHASPL		PPSAAPTTDS		TDSITGQNSR
QREEELELID		QLRKHIEYRL		KVSLPCDLGA		ALTDGVVLCH		LANHVRPRSV
PSIHVPSPAV		PKLTMAKCRR		NVENFLEACR		KIGVPQEQLC		LPLHILEEKG
LSQVAVTVQA		LLELAPPKQQ		QHQLSAV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r

Див. також

• Хромосома 3