NCS1

NCS1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4GUK, 1G8I, 2LCP, 5AER, 5AFP, 5AEQ
Ідентифікатори
Символи	NCS1, FLUP, FREQ, neuronal calcium sensor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 603315 MGI: 109166 HomoloGene: 5719 GeneCards: NCS1
Пов'язані генетичні захворювання
хвороба Альцгеймера
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • voltage-gated calcium channel activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • magnesium ion binding • protein kinase binding • voltage-gated calcium channel activity involved in regulation of presynaptic cytosolic calcium levels Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • postsynaptic membrane • комплекс Ґольджі • мембрана • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • внутрішньоклітинна мембранна органела • клітинна мембрана • синапс • аксон • міжклітинні контакти • дендрит (нейробіологія) • perinuclear region of cytoplasm • dense core granule • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • calyx of Held • postsynapse • glutamatergic synapse • presynaptic cytosol • postsynaptic cytosol Біологічний процес • regulation of neuron projection development • calcium ion transmembrane transport • positive regulation of exocytosis • phosphatidylinositol-mediated signaling • regulation of synaptic vesicle exocytosis • regulation of presynaptic cytosolic calcium ion concentration Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23413	14299
Ensembl	ENSG00000107130	ENSMUSG00000062661
UniProt	P62166	Q8BNY6
RefSeq (мРНК)	NM_014286 NM_001128826	NM_019681
RefSeq (білок)	NP_001122298 NP_055101	NP_062655
Локус (UCSC)	Хр. 9: 130.17 – 130.24 Mb	Хр. 2: 31.14 – 31.19 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NCS1 (англ. Neuronal calcium sensor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 190 амінокислот, а молекулярна маса — 21 879.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGKSNSKLKP		EVVEELTRKT		YFTEKEVQQW		YKGFIKDCPS		GQLDAAGFQK
IYKQFFPFGD		PTKFATFVFN		VFDENKDGRI		EFSEFIQALS		VTSRGTLDEK
LRWAFKLYDL		DNDGYITRNE		MLDIVDAIYQ		MVGNTVELPE		EENTPEKRVD
RIFAMMDKNA		DGKLTLQEFQ		EGSKADPSIV		QALSLYDGLV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних контактах, апараті гольджі, синапсах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Haynes L.P., Sherwood M.W., Dolman N.J., Burgoyne R.D. (2007). Specificity, promiscuity and localization of ARF protein interactions with NCS-1 and phosphatidylinositol-4 kinase-III beta. Traffic. 8: 1080—1092. PMID 17555535 DOI:10.1111/j.1600-0854.2007.00594.x
• Bourne Y., Dannenberg J., Pollmann V., Marchot P., Pongs O. (2001). Immunocytochemical localization and crystal structure of human frequenin (neuronal calcium sensor 1). J. Biol. Chem. 276: 11949—11955. PMID 11092894 DOI:10.1074/jbc.M009373200

Див. також

• Хромосома 9