PDF (ген)

PDF
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3G5K, 3G5P
Ідентифікатори
Символи	PDF, peptide deformylase (mitochondrial), peptide deformylase, mitochondrial
Зовнішні ІД	MGI: 1915273 HomoloGene: 69354 GeneCards: PDF
Онтологія гена Молекулярна функція • hydrolase activity • зв'язування з іоном металу • peptide deformylase activity Клітинна компонента • мітохондрія Біологічний процес • peptidyl-methionine modification • N-terminal protein amino acid modification • Біосинтез білків • positive regulation of cell population proliferation • co-translational protein modification Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	64146	68023
Ensembl	ENSG00000258429	ENSMUSG00000078931
UniProt	Q9HBH1	S4R2K0
RefSeq (мРНК)	NM_022341	NM_026513
RefSeq (білок)	NP_071736	NP_080789
Локус (UCSC)	Хр. 16: 69.33 – 69.33 Mb	Хр. 8: 107.77 – 107.78 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PDF (англ. Peptide deformylase, mitochondrial) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 243 амінокислот, а молекулярна маса — 27 013.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MARLWGALSL		WPLWAAVPWG		GAAAVGVRAC		SSTAAPDGVE		GPALRRSYWR
HLRRLVLGPP		EPPFSHVCQV		GDPVLRGVAA		PVERAQLGGP		ELQRLTQRLV
QVMRRRRCVG		LSAPQLGVPR		QVLALELPEA		LCRECPPRQR		ALRQMEPFPL
RVFVNPSLRV		LDSRLVTFPE		GCESVAGFLA		CVPRFQAVQI		SGLDPNGEQV
VWQASGWAAR		IIQHEMDHLQ		GCLFIDKMDS		RTFTNVYWMK		VND

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до гідролаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як біосинтез білків. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, кобальтом. Локалізований у мітохондрії.

Література

• Giglione C., Serero A., Pierre M., Boisson B., Meinnel T. (2000). Identification of eukaryotic peptide deformylases reveals universality of N-terminal protein processing mechanisms. EMBO J. 19: 5916—5929. PMID 11060042 DOI:10.1093/emboj/19.21.5916
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Serero A., Giglione C., Sardini A., Martinez-Sanz J., Meinnel T. (2003). An unusual peptide deformylase features in the human mitochondrial N-terminal methionine excision pathway. J. Biol. Chem. 278: 52953—52963. PMID 14532271 DOI:10.1074/jbc.M309770200

Див. також

• Хромосома 16