PTCH2

PTCH2
Ідентифікатори
Символи	PTCH2, PTC2, patched 2
Зовнішні ІД	OMIM: 603673 MGI: 1095405 HomoloGene: 37842 GeneCards: PTCH2
Онтологія гена Молекулярна функція • hedgehog receptor activity • hedgehog family protein binding • smoothened binding Клітинна компонента • мембрана • integral component of membrane • клітинна мембрана Біологічний процес • skin development • positive regulation of epidermal cell differentiation • hair cycle • epidermal cell fate specification • Детермінація • negative regulation of smoothened signaling pathway • epidermis development • GO:0072468 сигнальна трансдукція • smoothened signaling pathway • regulation of cell growth Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8643	19207
Ensembl	ENSG00000117425	ENSMUSG00000028681
UniProt	Q9Y6C5	O35595
RefSeq (мРНК)	NM_003738 NM_001166292	NM_008958 NM_001312903
RefSeq (білок)	NP_001159764 NP_003729	NP_001299832 NP_032984
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 4: 116.95 – 116.97 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PTCH2 (англ. Patched 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 203 амінокислот, а молекулярна маса — 130 544.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTRSPPLREL		PPSYTPPART		AAPQILAGSL		KAPLWLRAYF		QGLLFSLGCG
IQRHCGKVLF		LGLLAFGALA		LGLRMAIIET		NLEQLWVEVG		SRVSQELHYT
KEKLGEEAAY		TSQMLIQTAR		QEGENILTPE		ALGLHLQAAL		TASKVQVSLY
GKSWDLNKIC		YKSGVPLIEN		GMIERMIEKL		FPCVILTPLD		CFWEGAKLQG
GSAYLPGRPD		IQWTNLDPEQ		LLEELGPFAS		LEGFRELLDK		AQVGQAYVGR
PCLHPDDLHC		PPSAPNHHSR		QAPNVAHELS		GGCHGFSHKF		MHWQEELLLG
GMARDPQGEL		LRAEALQSTF		LLMSPRQLYE		HFRGDYQTHD		IGWSEEQAST
VLQAWQRRFV		QLAQEALPEN		ASQQIHAFSS		TTLDDILHAF		SEVSAARVVG
GYLLMLAYAC		VTMLRWDCAQ		SQGSVGLAGV		LLVALAVASG		LGLCALLGIT
FNAATTQVLP		FLALGIGVDD		VFLLAHAFTE		ALPGTPLQER		MGECLQRTGT
SVVLTSINNM		AAFLMAALVP		IPALRAFSLQ		AAIVVGCTFV		AVMLVFPAIL
SLDLRRRHCQ		RLDVLCCFSS		PCSAQVIQIL		PQELGDGTVP		VGIAHLTATV
QAFTHCEASS		QHVVTILPPQ		AHLVPPPSDP		LGSELFSPGG		STRDLLGQEE
ETRQKAACKS		LPCARWNLAH		FARYQFAPLL		LQSHAKAIVL		VLFGALLGLS
LYGATLVQDG		LALTDVVPRG		TKEHAFLSAQ		LRYFSLYEVA		LVTQGGFDYA
HSQRALFDLH		QRFSSLKAVL		PPPATQAPRT		WLHYYRNWLQ		GIQAAFDQDW
ASGRITRHSY		RNGSEDGALA		YKLLIQTGDA		QEPLDFSQLT		TRKLVDREGL
IPPELFYMGL		TVWVSSDPLG		LAASQANFYP		PPPEWLHDKY		DTTGENLRIP
PAQPLEFAQF		PFLLRGLQKT		ADFVEAIEGA		RAACAEAGQA		GVHAYPSGSP
FLFWEQYLGL		RRCFLLAVCI		LLVCTFLVCA		LLLLNPWTAG		LIVLVLAMMT
VELFGIMGFL		GIKLSAIPVV		ILVASVGIGV		EFTVHVALGF		LTTQGSRNLR
AAHALEHTFA		PVTDGAISTL		LGLLMLAGSH		FDFIVRYFFA		ALTVLTLLGL
LHGLVLLPVL		LSILGPPPEV		IQMYKESPEI		LSPPAPQGGG		LRWGASSSLP
QSFARVTTSM		TVAIHPPPLP		GAYIHPAPDE		PPWSPAATSS		GNLSSRGPGP
ATG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Локалізований у мембрані.

Література

• Zaphiropoulos P.G., Unden A.B., Rahnama F., Hollingsworth R.E., Toftgard R. (1999). PTCH2, a novel human patched gene, undergoing alternative splicing and up-regulated in basal cell carcinomas. Cancer Res. 59: 787—792. PMID 10029063

Див. також

• Хромосома 1