RAP1B

RAP1B
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3BRW, 3CF6, 4DXA, 4HDO, 4HDQ, 4M8N, 4MGI, 4MGK, 4MGY, 4MGZ, 4MH0
Ідентифікатори
Символи	RAP1B, K-REV, RAL1B, member of RAS oncogene family
Зовнішні ІД	OMIM: 179530 MGI: 894315 HomoloGene: 68719 GeneCards: RAP1B
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • GDP binding • GO:0032403 protein-containing complex binding • GTP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0006184 GTPase activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • мембрана • cell-cell junction • клітинна мембрана • lipid droplet • внутрішньоклітинний • міжклітинні контакти • membrane raft • екзосома • azurophil granule membrane Біологічний процес • establishment of endothelial barrier • microvillus assembly • regulation of cell junction assembly • Rap protein signal transduction • regulation of establishment of cell polarity • cellular response to cAMP • GO:0072468 сигнальна трансдукція • neutrophil degranulation • interleukin-12-mediated signaling pathway • small GTPase mediated signal transduction • проліферація • response to carbohydrate • negative regulation of calcium ion-dependent exocytosis • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound • cellular response to gonadotropin-releasing hormone • negative regulation of synaptic vesicle exocytosis Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5908	215449
Ensembl	ENSG00000127314	ENSMUSG00000052681
UniProt	P61224	Q99JI6
RefSeq (мРНК)	NM_015646 NM_001010942 NM_001251917 NM_001251918 NM_001251921 NM_001251922	NM_024457
RefSeq (білок)	NP_001010942 NP_001238846 NP_001238847 NP_001238850 NP_001238851 NP_056461 NP_001010942.1 NP_056461.1	NP_077777
Локус (UCSC)	Хр. 12: 68.61 – 68.67 Mb	Хр. 10: 117.65 – 117.68 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RAP1B (англ. RAP1B, member of RAS oncogene family) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 184 амінокислот, а молекулярна маса — 20 825.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MREYKLVVLG		SGGVGKSALT		VQFVQGIFVE		KYDPTIEDSY		RKQVEVDAQQ
CMLEILDTAG		TEQFTAMRDL		YMKNGQGFAL		VYSITAQSTF		NDLQDLREQI
LRVKDTDDVP		MILVGNKCDL		EDERVVGKEQ		GQNLARQWNN		CAFLESSAKS
KINVNEIFYD		LVRQINRKTP		VPGKARKKSS		CQLL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, клітинних контактах.

Література

• Pizon V., Lerosey I., Chardin P., Tavitian A. (1988). Nucleotide sequence of a human cDNA encoding a ras-related protein (rap1B). Nucleic Acids Res. 16: 7719—7719. PMID 3137530 DOI:10.1093/nar/16.15.7719
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Siess W., Winegar D.A., Lapetina E.G. (1990). Rap1-B is phosphorylated by protein kinase A in intact human platelets. Biochem. Biophys. Res. Commun. 170: 944—950. PMID 1696481 DOI:10.1016/0006-291X(90)92182-Y
• Yang H., Sasaki T., Minoshima S., Shimizu N. (2007). Identification of three novel proteins (SGSM1, 2, 3) which modulate small G protein (RAP and RAB)-mediated signaling pathway. Genomics. 90: 249—260. PMID 17509819 DOI:10.1016/j.ygeno.2007.03.013
• Scrima A., Thomas C., Deaconescu D., Wittinghofer A. (2008). The Rap-RapGAP complex: GTP hydrolysis without catalytic glutamine and arginine residues. EMBO J. 27: 1145—1153. PMID 18309292 DOI:10.1038/emboj.2008.30
• Bokoch G.M., Parkos C.A., Mumby S.M. (1988). Purification and characterization of the 22,000-dalton GTP-binding protein substrate for ADP-ribosylation by botulinum toxin, G22K. J. Biol. Chem. 263: 16744—16749. PMID 3141412

Див. також

• Хромосома 12