RAP2B

RAP2B
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1N4P, 1N4Q, 1N4R, 1N4S
Ідентифікатори
Символи	RAP2B, member of RAS oncogene family
Зовнішні ІД	OMIM: 179541 MGI: 1921262 HomoloGene: 55701 GeneCards: RAP2B
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleotide binding • protein domain specific binding • GDP binding • GTP binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0006184 GTPase activity Клітинна компонента • recycling endosome • гіалоплазма • ендосома • мембрана • cell-cell contact zone • bicellular tight junction • recycling endosome membrane • membrane raft • екзосома • клітинна мембрана • specific granule membrane • tertiary granule membrane Біологічний процес • regulation of protein tyrosine kinase activity • microvillus assembly • establishment of endothelial intestinal barrier • Rap protein signal transduction • platelet activation • negative regulation of cell migration • positive regulation of protein autophosphorylation • platelet aggregation • GO:0072468 сигнальна трансдукція • neutrophil degranulation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5912	74012
Ensembl	ENSG00000181467	ENSMUSG00000036894
UniProt	P61225	P61226
RefSeq (мРНК)	NM_002886	NM_028712
RefSeq (білок)	NP_002877	NP_082988
Локус (UCSC)	Хр. 3: 153.16 – 153.17 Mb	Хр. 3: 61.27 – 61.28 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RAP2B (англ. RAP2B, member of RAS oncogene family) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 183 амінокислот, а молекулярна маса — 20 504.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MREYKVVVLG		SGGVGKSALT		VQFVTGSFIE		KYDPTIEDFY		RKEIEVDSSP
SVLEILDTAG		TEQFASMRDL		YIKNGQGFIL		VYSLVNQQSF		QDIKPMRDQI
IRVKRYERVP		MILVGNKVDL		EGEREVSYGE		GKALAEEWSC		PFMETSAKNK
ASVDELFAEI		VRQMNYAAQP		NGDEGCCSAC		VIL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у мембрані, ендосомах.

Література

• Farrell F.X., Ohmstede C.A., Reep B.R., Lapetina E.G. (1990). cDNA sequence of a new ras-related gene (rap2b) isolated from human platelets with sequence homology to rap2. Nucleic Acids Res. 18: 4281—4281. PMID 2115998 DOI:10.1093/nar/18.14.4281
• Ohmstede C.A., Farrell F.X., Reep B.R., Clemetson K.J., Lapetina E.G. (1990). RAP2B: a RAS-related GTP-binding protein from platelets. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 87: 6527—6531. PMID 2118648 DOI:10.1073/pnas.87.17.6527
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Farrell F.X., Yamamoto K., Lapetina E.G. (1993). Prenyl group identification of rap2 proteins: a ras superfamily member other than ras that is farnesylated. Biochem. J. 289: 349—355. PMID 8424780 DOI:10.1042/bj2890349
• Yang H., Sasaki T., Minoshima S., Shimizu N. (2007). Identification of three novel proteins (SGSM1, 2, 3) which modulate small G protein (RAP and RAB)-mediated signaling pathway. Genomics. 90: 249—260. PMID 17509819 DOI:10.1016/j.ygeno.2007.03.013

Див. також

• Хромосома 3