RIPOR1

RIPOR1
Ідентифікатори
Символи	RIPOR1, FAM65A, RHO family interacting cell polarization regulator 1
Зовнішні ІД	MGI: 1922937 HomoloGene: 11564 GeneCards: RIPOR1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • 14-3-3 protein binding Клітинна компонента • екзосома • vesicle membrane • мембрана • cell leading edge • цитоплазма • комплекс Ґольджі Біологічний процес • Rho protein signal transduction • cellular response to starvation • response to wounding • positive regulation of cell migration • establishment of Golgi localization • positive regulation of intracellular protein transport • negative regulation of Rho protein signal transduction • cellular response to chemokine • negative regulation of Rho guanyl-nucleotide exchange factor activity • protein localization to Golgi apparatus Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	79567	75687
Ensembl	ENSG00000039523	ENSMUSG00000038604
UniProt	Q6ZS17	Q68FE6
RefSeq (мРНК)	NM_001193522 NM_001193523 NM_001193524 NM_024519	NM_001081241
RefSeq (білок)	NP_001180451 NP_001180452 NP_001180453 NP_078795	NP_001074710
Локус (UCSC)	Хр. 16: 67.52 – 67.55 Mb	Хр. 8: 106.33 – 106.35 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RIPOR1 (англ. RHO family interacting cell polarization regulator 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 16-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 223 амінокислот, а молекулярна маса — 132 308.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MMSLSVRPQR		RLLSARVNRS		QSFAGVLGSH		ERGPSLSFRS		FPVFSPPGPP
RKPPALSRVS		RMFSVAHPAA		KVPQPERLDL		VYTALKRGLT		AYLEVHQQEQ
EKLQGQIRES		KRNSRLGFLY		DLDKQVKSIE		RFLRRLEFHA		SKIDELYEAY
CVQRRLRDGA		YNMVRAYTTG		SPGSREARDS		LAEATRGHRE		YTESMCLLES
ELEAQLGEFH		LRMKGLAGFA		RLCVGDQYEI		CMKYGRQRWK		LRGRIEGSGK
QVWDSEETIF		LPLLTEFLSI		KVTELKGLAN		HVVVGSVSCE		TKDLFAALPQ
VVAVDINDLG		TIKLSLEVTW		SPFDKDDQPS		AASSVNKAST		VTKRFSTYSQ
SPPDTPSLRE		QAFYNMLRRQ		EELENGTAWS		LSSESSDDSS		SPQLSGTARH
SPAPRPLVQQ		PEPLPIQVAF		RRPETPSSGP		LDEEGAVAPV		LANGHAPYSR
TLSHISEASV		DAALAEASVE		AVGPESLAWG		PSPPTHPAPT		HGEHPSPVPP
ALDPGHSATS		STLGTTGSVP		TSTDPAPSAH		LDSVHKSTDS		GPSELPGPTH
TTTGSTYSAI		TTTHSAPSPL		THTTTGSTHK		PIISTLTTTG		PTLNIIGPVQ
TTTSPTHTMP		SPTHTTASPT		HTSTSPTHTP		TSPTHKTSMS		PPTTTSPTPS
GMGLVQTATS		PTHPTTSPTH		PTTSPILINV		SPSTSLELAT		LSSPSKHSDP
TLPGTDSLPC		SPPVSNSYTQ		ADPMAPRTPH		PSPAHSSRKP		LTSPAPDPSE
STVQSLSPTP		SPPTPAPQHS		DLCLAMAVQT		PVPTAAGGSG		DRSLEEALGA
LMAALDDYRG		QFPELQGLEQ		EVTRLESLLM		QRQGLTRSRA		SSLSITVEHA
LESFSFLNED		EDEDNDVPGD		RPPSSPEAGA		EDSIDSPSAR		PLSTGCPALD
AALVRHLYHC		SRLLLKLGTF		GPLRCQEAWA		LERLLREARV		LEAVCEFSRR
WEIPASSAQE		VVQFSASRPG		FLTFWDQCTE		RLSCFLCPVE		RVLLTFCNQY
GARLSLRQPG		LAEAVCVKFL		EDALGQKLPR		RPQPGPGEQL		TVFQFWSFVE
TLDSPTMEAY		VTETAEEVLL		VRNLNSDDQA		VVLKALRLAP		EGRLRRDGLR
ALSSLLVHGN		NKVMAAVSTQ		LRSLSLGPTF		RERALLCFLD		QLEDEDVQTR
VAGCLALGCI		KAPEGIEPLV		YLCQTDTEAV		REAARQSLQQ		CGEEGQSAHR
RLEESLDALP		RIFGPGSMAS		TAF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, апараті гольджі.

Література

• Nagase T., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XXI. The complete sequences of 60 new cDNA clones from brain which code for large proteins. DNA Res. 8: 179—187. PMID 11572484 DOI:10.1093/dnares/8.4.179
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240
• Mardakheh F.K., Self A., Marshall C.J. (2016). RHO binding to FAM65A regulates Golgi reorientation during cell migration. J. Cell Sci. 129: 4466—4479. PMID 27807006 DOI:10.1242/jcs.198614

Див. також

• Хромосома 16