RNF103-CHMP3

RNF103-CHMP3
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 2XZE, 3FRT, 3FRV, 2GD5
Ідентифікатори
Символи	RNF103-CHMP3, RNF103-VPS24, RNF103-CHMP3 readthrough, NEDF, hVps24, VPS24, CGI149, CHMP3
Зовнішні ІД	HomoloGene: 130401 GeneCards: RNF103-CHMP3
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • phosphatidylcholine binding • protein homodimerization activity • ubiquitin-specific protease binding • identical protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • мембрана • клітинна мембрана • ендосома • late endosome membrane • екзосома • ESCRT III complex • гіалоплазма • внутрішньоклітинний • late endosome • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • multivesicular body Біологічний процес • GO:0000046 autophagosome maturation • GO:0019067 viral life cycle • protein polymerization • multivesicular body assembly • клітинний цикл • поділ клітини • regulation of mitotic spindle assembly • endosomal transport • regulation of centrosome duplication • GO:0097285 апоптоз • protein heterooligomerization • vacuolar transport • septum digestion after cytokinesis • protein transport • nucleus organization • mitotic metaphase plate congression • multivesicular body sorting pathway • regulation of exosomal secretion • macroautophagy • multivesicular body-lysosome fusion • regulation of early endosome to late endosome transport • GO:0015915 транспорт • viral budding via host ESCRT complex • endosome transport via multivesicular body sorting pathway • late endosome to vacuole transport • midbody abscission Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	100526767	н/д
Ensembl	ENSG00000249884	н/д
UniProt	Q9Y3E7	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_001198954	н/д
RefSeq (білок)	NP_001005753 NP_001180446 NP_057163	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 2: 86.51 – 86.72 Mb	н/д
PubMed search		н/д
Вікідані
Див./Ред. для людей

RNF103-CHMP3 (англ. Charged multivesicular body protein 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 222 амінокислот, а молекулярна маса — 25 073.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGLFGKTQEK		PPKELVNEWS		LKIRKEMRVV		DRQIRDIQRE		EEKVKRSVKD
AAKKGQKDVC		IVLAKEMIRS		RKAVSKLYAS		KAHMNSVLMG		MKNQLAVLRV
AGSLQKSTEV		MKAMQSLVKI		PEIQATMREL		SKEMMKAGII		EEMLEDTFES
MDDQEEMEEE		AEMEIDRILF		EITAGALGKA		PSKVTDALPE		PEPPGAMAAS
EDEEEEEEAL		EAMQSRLATL		RS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як апоптоз, транспорт, транспорт білків, клітинний цикл, поділ клітини, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендосомах.

Література

• Wilson E.M., Oh Y., Hwa V., Rosenfeld R.G. (2001). Interaction of IGF-binding protein-related protein 1 with a novel protein, neuroendocrine differentiation factor, results in neuroendocrine differentiation of prostate cancer cells. J. Clin. Endocrinol. Metab. 86: 4504—4511. PMID 11549700 DOI:10.1210/jcem.86.9.7845
• Khoury C.M., Yang Z., Ismail S., Greenwood M.T. (2007). Characterization of a novel alternatively spliced human transcript encoding an N-terminally truncated Vps24 protein that suppresses the effects of Bax in an ESCRT independent manner in yeast. Gene. 391: 233—241. PMID 17331679 DOI:10.1016/j.gene.2006.12.039
• Lai C.-H., Chou C.-Y., Ch'ang L.-Y., Liu C.-S., Lin W.-C. (2000). Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics. Genome Res. 10: 703—713. PMID 10810093 DOI:10.1101/gr.10.5.703
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Martin-Serrano J., Yarovoy A., Perez-Caballero D., Bieniasz P.D. (2003). Divergent retroviral late-budding domains recruit vacuolar protein sorting factors by using alternative adaptor proteins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 12414—12419. PMID 14519844 DOI:10.1073/pnas.2133846100
• Lin Y., Kimpler L.A., Naismith T.V., Lauer J.M., Hanson P.I. (2005). Interaction of the mammalian endosomal sorting complex required for transport (ESCRT) III protein hSnf7-1 with itself, membranes, and the AAA+ ATPase SKD1. J. Biol. Chem. 280: 12799—12809. PMID 15632132 DOI:10.1074/jbc.M413968200

Див. також

• Хромосома 2