S100A1

S100A1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2L0P, 2LHL, 2LLS, 2LLT, 2LLU, 2LP2, 2LP3, 2LUX, 2M3W
Ідентифікатори
Символи	S100A1, S100, S100-alpha, S100A, S100 calcium-binding protein A1, S100 calcium binding protein A1
Зовнішні ІД	OMIM: 176940 MGI: 1338917 HomoloGene: 4566 GeneCards: S100A1
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • S100 protein binding • protein homodimerization activity • ATPase binding • calcium-dependent protein binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • M band • I band • sarcoplasmic reticulum • Z disc • neuron projection • A band • клітинне ядро • extracellular region • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • GO:0007243 intracellular signal transduction • regulation of heart contraction • substantia nigra development • positive regulation of voltage-gated calcium channel activity • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • toll-like receptor signaling pathway • positive regulation of nitric-oxide synthase activity • positive regulation of sprouting angiogenesis Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6271	20193
Ensembl	ENSG00000160678	ENSMUSG00000044080
UniProt	P23297	P56565
RefSeq (мРНК)	NM_006271	NM_011309
RefSeq (білок)	NP_006262	NP_035439
Локус (UCSC)	Хр. 1: 153.63 – 153.63 Mb	Хр. 3: 90.42 – 90.42 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

S100A1 (англ. S100 calcium binding protein A1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 94 амінокислот, а молекулярна маса — 10 546.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGSELETAME		TLINVFHAHS		GKEGDKYKLS		KKELKELLQT		ELSGFLDAQK
DVDAVDKVMK		ELDENGDGEV		DFQEYVVLVA		ALTVACNNFF		WENS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
Q: Глутамін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Engelkamp D., Schaefer B.W., Erne P., Heizmann C.W. (1992). S100 alpha, CAPL, and CACY: molecular cloning and expression analysis of three calcium-binding proteins from human heart. Biochemistry. 31: 10258—10264. PMID 1384693 DOI:10.1021/bi00157a012
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Filipek A., Jastrzebska B., Nowotny M., Kuznicki J. (2002). CacyBP/SIP, a calcyclin and Siah-1-interacting protein, binds EF-hand proteins of the S100 family. J. Biol. Chem. 277: 28848—28852. PMID 12042313 DOI:10.1074/jbc.M203602200
• Shimamoto S., Kubota Y., Tokumitsu H., Kobayashi R. (2010). S100 proteins regulate the interaction of Hsp90 with cyclophilin 40 and FKBP52 through their tetratricopeptide repeats. FEBS Lett. 584: 1119—1125. PMID 20188096 DOI:10.1016/j.febslet.2010.02.055

Див. також

• Хромосома 1