SCG2

SCG2
Ідентифікатори
Символи	SCG2, CHGC, SN, SgII, secretogranin II
Зовнішні ІД	OMIM: 118930 MGI: 103033 HomoloGene: 2591 GeneCards: SCG2
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • chemoattractant activity • cytokine activity Клітинна компонента • extracellular region • dense core granule • secretory granule • міжклітинний простір • neuronal dense core vesicle • endoplasmic reticulum lumen Біологічний процес • protein secretion • induction of positive chemotaxis • negative regulation of endothelial cell apoptotic process • eosinophil chemotaxis • positive chemotaxis • negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway • GO:0007243 intracellular signal transduction • inflammatory response • positive regulation of endothelial cell proliferation • endothelial cell migration • Ангіогенез • MAPK cascade • negative regulation of endothelial cell proliferation • посттрансляційна модифікація • regulation of signaling receptor activity Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7857	20254
Ensembl	ENSG00000171951	ENSMUSG00000050711
UniProt	P13521 P15321	Q03517
RefSeq (мРНК)	NM_003469	NM_009129 NM_001310680
RefSeq (білок)	NP_003460	NP_001297609 NP_033155
Локус (UCSC)	Хр. 2: 223.6 – 223.6 Mb	Хр. 1: 79.41 – 79.42 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SCG2 (англ. Secretogranin II) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 617 амінокислот, а молекулярна маса — 70 941.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAEAKTHWLG		AALSLIPLIF		LISGAEAASF		QRNQLLQKEP		DLRLENVQKF
PSPEMIRALE		YIENLRQQAH		KEESSPDYNP		YQGVSVPLQQ		KENGDESHLP
ERDSLSEEDW		MRIILEALRQ		AENEPQSAPK		ENKPYALNSE		KNFPMDMSDD
YETQQWPERK		LKHMQFPPMY		EENSRDNPFK		RTNEIVEEQY		TPQSLATLES
VFQELGKLTG		PNNQKRERMD		EEQKLYTDDE		DDIYKANNIA		YEDVVGGEDW
NPVEEKIESQ		TQEEVRDSKE		NIEKNEQIND		EMKRSGQLGI		QEEDLRKESK
DQLSDDVSKV		IAYLKRLVNA		AGSGRLQNGQ		NGERATRLFE		KPLDSQSIYQ
LIEISRNLQI		PPEDLIEMLK		TGEKPNGSVE		PERELDLPVD		LDDISEADLD
HPDLFQNRML		SKSGYPKTPG		RAGTEALPDG		LSVEDILNLL		GMESAANQKT
SYFPNPYNQE		KVLPRLPYGA		GRSRSNQLPK		AAWIPHVENR		QMAYENLNDK
DQELGEYLAR		MLVKYPEIIN		SNQVKRVPGQ		GSSEDDLQEE		EQIEQAIKEH
LNQGSSQETD		KLAPVSKRFP		VGPPKNDDTP		NRQYWDEDLL		MKVLEYLNQE
KAEKGREHIA		KRAMENM

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Beranova-Giorgianni S., Zhao Y., Desiderio D.M., Giorgianni F. (2006). Phosphoproteomic analysis of the human pituitary. Pituitary. 9: 109—120. PMID 16807684 DOI:10.1007/s11102-006-8916-x
• Halim A., Ruetschi U., Larson G., Nilsson J. (2013). LC-MS/MS characterization of O-glycosylation sites and glycan structures of human cerebrospinal fluid glycoproteins. J. Proteome Res. 12: 573—584. PMID 23234360 DOI:10.1021/pr300963h

Див. також

• Хромосома 2