SCHIP1

SCHIP1
Ідентифікатори
Символи	SCHIP1, SCHIP-1, schwannomin interacting protein 1
Зовнішні ІД	MGI: 1353557 HomoloGene: 130673 GeneCards: SCHIP1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding Клітинна компонента • цитоплазма Біологічний процес • GO:0022610 життєдіяльність Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	29970	30953
Ensembl	ENSG00000151967	ENSMUSG00000027777
UniProt	P0DPB3	A0A097PIJ2
RefSeq (мРНК)	NM_014575 NM_001197107 NM_001197108 NM_001197109	NM_001113420 NM_001113421 NM_001282044 NM_001282045 NM_013928
RefSeq (білок)	NP_001184042 NP_001184043 NP_001184036 NP_001184037 NP_001184038 NP_055390	NP_001106891 NP_001106892 NP_001268973 NP_001268974 NP_038956 NP_001106890
Локус (UCSC)	Хр. 3: 159.84 – 159.9 Mb	Хр. 3: 67.97 – 68.53 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SCHIP1 (англ. IQCJ-SCHIP1 readthrough) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 3-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 487 амінокислот, а молекулярна маса — 53 480.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MERSGQRVTT		WDCDQGKHSD		SDYREDGMDL		GSDAGSSSSS		SRASSQSNST
KVTPCSECKS		SSSPGGSLDL		VSALEDYEEP		FPVYQKKVID		EWAPEEDGEE
EEEEDERDQR		GYRDDRSPAR		EPGDVSARTR		SGGGGGRSAT		TAMPPPVPNG
NLHQHDPQDL		RHNGNVVVAG		RPSCSRGPRR		AIQKPQPAGG		RRSGRGPAAG
GLCLQPPDGG		TCVPEEPPVP		PMDWEALEKH		LAGLQFREQE		VRNQGQARTN
STSAQKNERE		SIRQKLALGS		FFDDGPGIYT		SCSKSGKPSL		SSRLQSGMNL
QICFVNDSGS		DKDSDADDSK		TETSLDTPLS		PMSKQSSSYS		DRDTTEEESE
SLDDMDFLTR		QKKLQAEAKM		ALAMAKPMAK		MQVEVEKQNR		KKSPVADLLP
HMPHISECLM		KRSLKPTDLR		DMTIGQLQVI		VNDLHSQIES		LNEELVQLLL
IRDELHTEQD		AMLVDIEDLT		RHAESQQKHM		AEKMPAK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Goutebroze L., Brault E., Muchardt C., Camonis J., Thomas G. (2000). Cloning and characterization of SCHIP-1, a novel protein interacting specifically with spliced isoforms and naturally occurring mutant NF2 proteins. Mol. Cell. Biol. 20: 1699—1712. PMID 10669747 DOI:10.1128/MCB.20.5.1699-1712.2000
• Kwasnicka-Crawford D.A., Carson A.R., Scherer S.W. (2006). IQCJ-SCHIP1, a novel fusion transcript encoding a calmodulin-binding IQ motif protein. Biochem. Biophys. Res. Commun. 350: 890—899. PMID 17045569 DOI:10.1016/j.bbrc.2006.09.136
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 3