SDC4

SDC4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1EJP, 1EJQ, 1OBY, 1YBO
Ідентифікатори
Символи	SDC4, SYND4, syndecan 4
Зовнішні ІД	OMIM: 600017 MGI: 1349164 HomoloGene: 31121 GeneCards: SDC4
Онтологія гена Молекулярна функція • fibronectin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • thrombospondin receptor activity • protein kinase C binding • identical protein binding Клітинна компонента • integral component of membrane • мембрана • focal adhesion • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • extracellular region • lysosomal lumen • Golgi lumen • membrane raft • costamere • екзосома • cell surface Біологічний процес • glycosaminoglycan metabolic process • ureteric bud development • inner ear receptor cell stereocilium organization • positive regulation of extracellular exosome assembly • Загоєння ран • retinoid metabolic process • neural tube closure • glycosaminoglycan catabolic process • glycosaminoglycan biosynthetic process • positive regulation of focal adhesion assembly • positive regulation of exosomal secretion • regulation of fibroblast migration • positive regulation of stress fiber assembly • positive regulation of protein kinase activity • GO:0072468 сигнальна трансдукція • negative regulation of T cell proliferation • leukocyte migration • cell migration Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6385	20971
Ensembl	ENSG00000124145	ENSMUSG00000017009
UniProt	P31431	O35988
RefSeq (мРНК)	NM_002999	NM_011521
RefSeq (білок)	NP_002990	NP_035651
Локус (UCSC)	Хр. 20: 45.33 – 45.35 Mb	Хр. 2: 164.27 – 164.29 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SDC4 (англ. Syndecan 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 198 амінокислот, а молекулярна маса — 21 642.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAPARLFALL		LFFVGGVAES		IRETEVIDPQ		DLLEGRYFSG		ALPDDEDVVG
PGQESDDFEL		SGSGDLDDLE		DSMIGPEVVH		PLVPLDNHIP		ERAGSGSQVP
TEPKKLEENE		VIPKRISPVE		ESEDVSNKVS		MSSTVQGSNI		FERTEVLAAL
IVGGIVGILF		AVFLILLLMY		RMKKKDEGSY		DLGKKPIYKK		APTNEFYA

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані. Також секретований назовні.

Література

• David G., van der Schueren B., Marynen P., Cassiman J.-J., van den Berghe H. (1992). Molecular cloning of amphiglycan, a novel integral membrane heparan sulfate proteoglycan expressed by epithelial and fibroblastic cells. J. Cell Biol. 118: 961—969. PMID 1500433 DOI:10.1083/jcb.118.4.961
• Kojima T., Inazawa J., Takamatsu J., Rosenberg R.D., Saito H. (1993). Human ryudocan core protein: molecular cloning and characterization of the cDNA, and chromosomal localization of the gene. Biochem. Biophys. Res. Commun. 190: 814—822. PMID 7916598 DOI:10.1006/bbrc.1993.1122
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Subramanian S.V., Fitzgerald M.L., Bernfield M. (1997). Regulated shedding of syndecan-1 and -4 ectodomains by thrombin and growth factor receptor activation. J. Biol. Chem. 272: 14713—14720. PMID 9169435 DOI:10.1074/jbc.272.23.14713
• Xing Y., Xu Q., Lee C. (2003). Widespread production of novel soluble protein isoforms by alternative splicing removal of transmembrane anchoring domains. FEBS Lett. 555: 572—578. PMID 14675776 DOI:10.1016/S0014-5793(03)01354-1
• Bhatt A.S., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Craik C.S., Moasser M.M. (2005). Adhesion signaling by a novel mitotic substrate of src kinases. Oncogene. 24: 5333—5343. PMID 16007225 DOI:10.1038/sj.onc.1208582

Див. також

• Хромосома 20