SDSL

SDSL
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2RKB
Ідентифікатори
Символи	SDSL, SDH 2, SDS-RS1, TDH, cSDH, serine dehydratase like
Зовнішні ІД	MGI: 2182607 HomoloGene: 44224 GeneCards: SDSL
шифр КФ	4.3.1.19
Онтологія гена Молекулярна функція • L-threonine ammonia-lyase activity • L-serine ammonia-lyase activity • lyase activity • identical protein binding • pyridoxal phosphate binding • молекулярна функція • hydro-lyase activity Клітинна компонента • гіалоплазма Біологічний процес • cellular amino acid metabolic process • GO:0022610 життєдіяльність • L-threonine catabolic process to glycine • L-serine catabolic process • threonine catabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	113675	257635
Ensembl	ENSG00000139410	ENSMUSG00000029596
UniProt	Q96GA7	Q8R238
RefSeq (мРНК)	NM_001304993 NM_138432	NM_133902 NM_001384254
RefSeq (білок)	NP_001291922 NP_612441	NP_598663 NP_001371183
Локус (UCSC)	Хр. 12: 113.42 – 113.44 Mb	Хр. 5: 120.6 – 120.61 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SDSL (англ. Serine dehydratase like) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 12-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 329 амінокислот, а молекулярна маса — 34 674.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDGPVAEHAK		QEPFHVVTPL		LESWALSQVA		GMPVFLKCEN		VQPSGSFKIR
GIGHFCQEMA		KKGCRHLVCS		SGGNAGIAAA		YAARKLGIPA		TIVLPESTSL
QVVQRLQGEG		AEVQLTGKVW		DEANLRAQEL		AKRDGWENVP		PFDHPLIWKG
HASLVQELKA		VLRTPPGALV		LAVGGGGLLA		GVVAGLLEVG		WQHVPIIAME
THGAHCFNAA		ITAGKLVTLP		DITSVAKSLG		AKTVAARALE		CMQVCKIHSE
VVEDTEAVSA		VQQLLDDERM		LVEPACGAAL		AAIYSGLLRR		LQAEGCLPPS
LTSVVVIVCG		GNNINSRELQ		ALKTHLGQV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до ліаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з піридоксаль-фосфатом.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 12