SLC35C2

SLC35C2
Ідентифікатори
Символи	SLC35C2, BA394O2.1, C20orf5, CGI-15, OVCOV1, solute carrier family 35 member C2
Зовнішні ІД	MGI: 2385166 HomoloGene: 6581 GeneCards: SLC35C2
Онтологія гена Молекулярна функція • antiporter activity • GO:0022891 transmembrane transporter activity Клітинна компонента • integral component of membrane • cis-Golgi network • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment membrane • мембрана • endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment • нуклеоплазма • комплекс Ґольджі Біологічний процес • protein O-linked fucosylation • fucosylation • negative regulation of gene expression • positive regulation of Notch signaling pathway • UDP-glucose transmembrane transport Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51006	228875
Ensembl	ENSG00000080189	ENSMUSG00000017664
UniProt	Q9NQQ7	Q8VCX2
RefSeq (мРНК)	NM_001281457 NM_001281458 NM_001281459 NM_001281460 NM_015945 NM_173073 NM_173179	NM_001252573 NM_001252574 NM_001252575 NM_144893 NM_001363015 NM_001363016
RefSeq (білок)	NP_001268386 NP_001268387 NP_001268388 NP_001268389 NP_057029 NP_775096 NP_775271	NP_001239502 NP_001239503 NP_001239504 NP_659142 NP_001349944 NP_001349945
Локус (UCSC)	Хр. 20: 46.35 – 46.36 Mb	Хр. 2: 165.12 – 165.13 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SLC35C2 (англ. Solute carrier family 35 member C2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 365 амінокислот, а молекулярна маса — 40 432.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGRWALDVAF		LWKAVLTLGL		VLLYYCFSIG		ITFYNKWLTK		SFHFPLFMTM
LHLAVIFLFS		ALSRALVQCS		SHRARVVLSW		ADYLRRVAPT		ALATALDVGL
SNWSFLYVTV		SLYTMTKSSA		VLFILIFSLI		FKLEELRAAL		VLVVLLIAGG
LFMFTYKSTQ		FNVEGFALVL		GASFIGGIRW		TLTQMLLQKA		ELGLQNPIDT
MFHLQPLMFL		GLFPLFAVFE		GLHLSTSEKI		FRFQDTGLLL		RVLGSLFLGG
ILAFGLGFSE		FLLVSRTSSL		TLSIAGIFKE		VCTLLLAAHL		LGDQISLLNW
LGFALCLSGI		SLHVALKALH		SRGDGGPKAL		KGLGSSPDLE		LLLRSSQREE
GDNEEEEYFV		AQGQQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, альтернативний сплайсинг. Локалізований у мембрані, апараті гольджі.

Література

• Lai C.-H., Chou C.-Y., Ch'ang L.-Y., Liu C.-S., Lin W.-C. (2000). Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics. Genome Res. 10: 703—713. PMID 10810093 DOI:10.1101/gr.10.5.703
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lu L., Hou X., Shi S., Korner C., Stanley P. (2010). Slc35c2 promotes Notch1 fucosylation and is required for optimal Notch signaling in mammalian cells. J. Biol. Chem. 285: 36245—36254. PMID 20837470 DOI:10.1074/jbc.M110.126003
• Leach R.E., Duniec-Dmuchowski Z.M., Tanaka T.S., Ko M.S.H., Krawetz S.A. (2001). Assignment of OVCOV1 (alias CGI-15) to human chromosome 20 band q13.1-->q13.2 by fluorescent in situ hybridization. Cytogenet. Cell Genet. 94: 252—253. PMID 11856893

Див. також

• Хромосома 20