SMYD4

SMYD4
Ідентифікатори
Символи	SMYD4, ZMYND21, SET and MYND domain containing 4
Зовнішні ІД	MGI: 2442796 HomoloGene: 35098 GeneCards: SMYD4
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	114826	319822
Ensembl	ENSG00000186532	ENSMUSG00000018809
UniProt	Q8IYR2	Q8BTK5
RefSeq (мРНК)	NM_052928	NM_001102611 NM_177009
RefSeq (білок)	NP_443160	NP_001096081
Локус (UCSC)	Хр. 17: 1.78 – 1.83 Mb	Хр. 11: 75.24 – 75.3 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SMYD4 (англ. SET and MYND domain containing 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 804 амінокислот, а молекулярна маса — 89 225.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MDLPVDEWKS		YLLQKWASLP		TSVQVTISTA		ETLRDIFLHS		SSLLQPEDEL
FLKRLSKGYL		VGKDSDAPLF		YREEGNKKFQ		EKDYTGAAVL		YSKGVSHSRP
NTEDMSLCHA		NRSAALFHLG		QYETCLKDIN		RAQTHGYPER		LQPKIMLRKA
ECLVALGRLQ		EASQTISDLE		RNFTATPALA		DVLPQTLQRN		LHRLKMKMQE
KDSLTESFPA		ALAKTLEDAA		LREENEQLSN		ASSSIGLCVD		PLKGRCLVAT
KDILPGELLV		QEDAFVSVLN		PGELPPPHHG		LDSKWDTRVT		NGDLYCHRCL
KHTLATVPCD		GCSYAKYCSQ		ECLQQAWELY		HRTECPLGGL		LLTLGVFCHI
ALRLTLLVGF		EDVRKIITKL		CDKISNKDIC		LPESNNQVKT		LNYGLGESEK
NGNIVETPIP		GCDINGKYEN		NYNAVFNLLP		HTENHSPEHK		FLCALCVSAL
CRQLEAASLQ		AIPTERIVNS		SQLKAAVTPE		LCPDVTIWGV		AMLRHMLQLQ
CNAQAMTTIQ		HTGPKGSIVT		DSRQVRLATG		IFPVISLLNH		SCSPNTSVSF
ISTVATIRAS		QRIRKGQEIL		HCYGPHKSRM		GVAERQQKLR		SQYFFDCACP
ACQTEAHRMA		AGPRWEAFCC		NSCGAPMQGD		DVLRCGSRSC		AESAVSRDHL
VSRLQDLQQQ		VRVAQKLLRD		GELERAVQRL		SGCQRDAESF		LWAEHAVVGE
IADGLARACA		ALGDWQKSAT		HLQRSLYVVE		VRHGPSSVEM		GHELFKLAQI
FFNGFAVPEA		LSTIQKAEEV		LSLHCGPWDD		EIQELQKMKS		CLLDLPPTPV
GPAL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, метилтрансфераз. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, S-аденозил-L-метіоніном.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Nagase T., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XXI. The complete sequences of 60 new cDNA clones from brain which code for large proteins. DNA Res. 8: 179—187. PMID 11572484 DOI:10.1093/dnares/8.4.179

Див. також

• Хромосома 17