SNAP47

SNAP47
Ідентифікатори
Символи	SNAP47, C1orf142, HEL170, SNAP-47, SVAP1, ESFI5812, HEL-S-290, synaptosome associated protein 47kDa, synaptosome associated protein 47, uncharacterized LOC100130093
Зовнішні ІД	MGI: 1915076 HomoloGene: 14206 GeneCards: SNAP47
Онтологія гена Молекулярна функція • SNAP receptor activity • syntaxin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • SNARE complex • perinuclear region of cytoplasm • система ендомембран • клітинна мембрана • BLOC-1 complex • мембрана • цитоплазма • neuronal cell body • дендрит (нейробіологія) • synaptic vesicle membrane • glutamatergic synapse • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • asymmetric synapse • hippocampal mossy fiber to CA3 synapse Біологічний процес • synaptic vesicle priming • довготривала потенціація • synaptic vesicle fusion to presynaptic active zone membrane • exocytic insertion of neurotransmitter receptor to postsynaptic membrane • vesicle-mediated transport in synapse • екзоцитоз • vesicle fusion Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	116841	67826
Ensembl	ENSG00000143740	ENSMUSG00000009894
UniProt	Q5SQN1	Q8R570
RefSeq (мРНК)	н/д	NM_144521 NM_001356452 NM_001356454
RefSeq (білок)	NP_001310859 NP_001310860 NP_001310861 NP_001310862 NP_001310863 NP_001310864 NP_444280	NP_653104 NP_001343381 NP_001343383
Локус (UCSC)	н/д	Хр. 11: 59.3 – 59.34 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SNAP47 (англ. Synaptosome associated protein 47) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 464 амінокислот, а молекулярна маса — 52 562.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRAARRGLHC		AGAERPRRRG		RLWDSSGVPQ		RQKRPGPWRT		QTQEQMSRDV
CIHTWPCTYY		LEPKRRWVTG		QLSLTSLSLR		FMTDSTGEIL		VSFPLSSIVE
IKKEASHFIF		SSITILEKGH		AKHWFSSLRP		SRNVVFSIIE		HFWRELLLSQ
PGAVADASVP		RTRGEELTGL		MAGSQKRLED		TARVLHHQGQ		QLDSVMRGLD
KMESDLEVAD		RLLTELESPA		WWPFSSKLWK		TPPETKPRED		VSMTSCEPFG
KEGILIKIPA		VISHRTESHV		KPGRLTVLVS		GLEIHDSSSL		LMHRFEREDV
DDIKVHSPYE		ISIRQRFIGK		PDMAYRLISA		KMPEVIPILE		VQFSKKMELL
EDALVLRSAR		TSSPAEKSCS		VWHAASGLMG		RTLHREPPAG		DQEGTALHLQ
TSLPALSEAD		TQELTQILRR		MKGLALEAES		ELERQDEALD		GVAAAVDRAT
LTIDKHNRRM		KRLT

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, мембрані.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1