SOGA1

SOGA1
Ідентифікатори
Символи	SOGA1, C20orf117, KIAA0889, SOGA, suppressor of glucose, autophagy associated 1
Зовнішні ІД	MGI: 2444575 HomoloGene: 52382 GeneCards: SOGA1
Онтологія гена Молекулярна функція • молекулярна функція Клітинна компонента • extracellular region • екзосома • міжклітинний простір Біологічний процес • negative regulation of gluconeogenesis • GO:1901047 insulin receptor signaling pathway • regulation of autophagy Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	140710	320706
Ensembl	ENSG00000149639	ENSMUSG00000055485
UniProt	O94964	E1U8D0 A2ACV6
RefSeq (мРНК)	NM_199181 NM_080627 NM_152257	NM_001164663
RefSeq (білок)	NP_542194 NP_954650	NP_001158135
Локус (UCSC)	Хр. 20: 36.78 – 36.86 Mb	Хр. 2: 156.86 – 156.92 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SOGA1 (англ. Suppressor of glucose, autophagy associated 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 423 амінокислот, а молекулярна маса — 159 760.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLEMRDVYME		EDVYQLQELR		QQLDQASKTC		RILQYRLRKA		ERRSLRAAQT
GQVDGELIRG		LEQDVKVSKD		ISMRLHKELE		VVEKKRARLE		EENEELRQRL
IETELAKQVL		QTELERPREH		SLKKRGTRSL		GKADKKTLVQ		EDSADLKCQL
HFAKEESALM		CKKLTKLAKE		NDSMKEELLK		YRSLYGDLDS		ALSAEELADA
PHSRETELKV		HLKLVEEEAN		LLSRRIVELE		VENRGLRAEM		DDMKDHGGGC
GGPEARLAFS		ALGGGECGES		LAELRRHLQF		VEEEAELLRR		SSAELEDQNK
LLLNELAKFR		SEHELDVALS		EDSCSVLSEP		SQEELAAAKL		QIGELSGKVK
KLQYENRVLL		SNLQRCDLAS		CQSTRPMLET		DAEAGDSAQC		VPAPLGETHE
SHAVRLCRAR		EAEVLPGLRE		QAALVSKAID		VLVADANGFT		AGLRLCLDNE
CADFRLHEAP		DNSEGPRDTK		LIHAILVRLS		VLQQELNAFT		RKADAVLGCS
VKEQQESFSS		LPPLGSQGLS		KEILLAKDLG		SDFQPPDFRD		LPEWEPRIRE
AFRTGDLDSK		PDPSRSFRPY		RAEDNDSYAS		EIKELQLVLA		EAHDSLRGLQ
EQLSQERQLR		KEEADNFNQK		MVQLKEDQQR		ALLRREFELQ		SLSLQRRLEQ
KFWSQEKNML		VQESQQFKHN		FLLLFMKLRW		FLKRWRQGKV		LPSEGDDFLE
VNSMKELYLL		MEEEEINAQH		SDNKACTGDS		WTQNTPNEYI		KTLADMKVTL
KELCWLLRDE		RRGLTELQQQ		FAKAKATWET		ERAELKGHTS		QMELKTGKGA
GERAGPDWKA		ALQREREEQQ		HLLAESYSAV		MELTRQLQIS		ERNWSQEKLQ
LVERLQGEKQ		QVEQQVKELQ		NRLSQLQKAA		DPWVLKHSEL		EKQDNSWKET
RSEKIHDKEA		VSEVELGGNG		LKRTKSVSSM		SEFESLLDCS		PYLAGGDARG
KKLPNNPAFG		FVSSEPGDPE		KDTKEKPGLS		SRDCNHLGAL		ACQDPPGRQM
QRSYTAPDKT		GIRVYYSPPV		ARRLGVPVVH		DKEGKIIIEP		GFLFTTAKPK
ESAEADGLAE		SSYGRWLCNF		SRQRLDGGSA		GSPSAAGPGF		PAALHDFEMS
GNMSDDMKEI		TNCVRQAMRS		GSLERKVKST		SSQTVGLASV		GTQTIRTVSV
GLQTDPPRSS		LHGKAWSPRS		SSLVSVRSKQ		ISSSLDKVHS		RIERPCCSPK
YGSPKLQRRS		VSKLDSSKDR		SLWNLHQGKQ		NGSAWARSTT		TRDSPVLRNI
NDGLSSLFSV		VEHSGSTESV		WKLGMSETRA		KPEPPKYGIV		QEFFRNVCGR
APSPTSSAGE		EGTKKPEPLS		PASYHQPEGV		ARILNKKAAK		LGSSEEVRLT
MLPQVGKDGV		LRDGDGAVVL		PNEDAVCDCS		TQSLTSCFAR		SSRSAIRHSP
SKCRLHPSES		SWGGEERALP		PSE

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 20