SRSF3

SRSF3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2I38
Ідентифікатори
Символи	SRSF3, SFRS3, SRp20, serine/arginine-rich splicing factor 3, serine and arginine rich splicing factor 3
Зовнішні ІД	OMIM: 603364 MGI: 98285 HomoloGene: 55708 GeneCards: SRSF3
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleic acid binding • sequence-specific mRNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding Клітинна компонента • клітинне ядро • цитоплазма • нуклеоплазма • nuclear speck Біологічний процес • termination of RNA polymerase II transcription • mRNA 3'-end processing • mRNA splicing, via spliceosome • mRNA export from nucleus • mRNA transport • mRNA processing • Сплайсинг РНК • regulation of mRNA splicing, via spliceosome • RNA export from nucleus • GO:0015915 транспорт • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome • mRNA cis splicing, via spliceosome Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6428	20383
Ensembl	ENSG00000112081	ENSMUSG00000071172
UniProt	P84103	P84104
RefSeq (мРНК)	NM_003017	NM_013663
RefSeq (білок)	NP_003008	NP_038691
Локус (UCSC)	Хр. 6: 36.59 – 36.61 Mb	Хр. 17: 29.25 – 29.26 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SRSF3 (англ. Serine and arginine rich splicing factor 3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 164 амінокислот, а молекулярна маса — 19 330.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MHRDSCPLDC		KVYVGNLGNN		GNKTELERAF		GYYGPLRSVW		VARNPPGFAF
VEFEDPRDAA		DAVRELDGRT		LCGCRVRVEL		SNGEKRSRNR		GPPPSWGRRP
RDDYRRRSPP		PRRRSPRRRS		FSRSRSRSLS		RDRRRERSLS		RERNHKPSRS
FSRSRSRSRS		NERK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, транспорт, транспорт мРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• Zahler A.M., Lane W.S., Stolk J.A., Roth M.B. (1992). SR proteins: a conserved family of pre-mRNA splicing factors. Genes Dev. 6: 837—847. PMID 1577277 DOI:10.1101/gad.6.5.837
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Barnard D.C., Patton J.G. (2000). Identification and characterization of a novel serine-arginine-rich splicing regulatory protein. Mol. Cell. Biol. 20: 3049—3057. PMID 10757789 DOI:10.1128/MCB.20.9.3049-3057.2000
• Huang Y., Steitz J.A. (2001). Splicing factors SRp20 and 9G8 promote the nucleocytoplasmic export of mRNA. Mol. Cell. 7: 899—905. PMID 11336712 DOI:10.1016/S1097-2765(01)00233-7
• Huang Y., Gattoni R., Stevenin J., Steitz J.A. (2003). SR splicing factors serve as adapter proteins for TAP-dependent mRNA export. Mol. Cell. 11: 837—843. PMID 12667464 DOI:10.1016/S1097-2765(03)00089-3
• Elliott D.J. (2004). The role of potential splicing factors including RBMY, RBMX, hnRNPG-T and STAR proteins in spermatogenesis. Int. J. Androl. 27: 328—334. PMID 15595951 DOI:10.1111/j.1365-2605.2004.00496.x

Див. також

• Хромосома 6