SSBP1

SSBP1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1S3O, 2DUD, 3ULL
Ідентифікатори
Символи	SSBP1, Mt-SSB, SOSS-B1, SSBP, mtSSB, single stranded DNA binding protein 1, OPA13
Зовнішні ІД	OMIM: 600439 MGI: 1920040 HomoloGene: 74462 GeneCards: SSBP1
Пов'язані генетичні захворювання
optic atrophy with negative Electroretinograms
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • single-stranded DNA binding • chromatin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding Клітинна компонента • мітохондріальний матрикс • mitochondrial nucleoid • екзосома • мітохондрія • клітинне ядро • нуклеоїд Біологічний процес • реплікація ДНК • mitochondrion organization • mitochondrion morphogenesis • positive regulation of helicase activity • mitochondrial DNA replication Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6742	381760
Ensembl	ENSG00000262771 ENSG00000106028	ENSMUSG00000029911
UniProt	Q04837	Q9CYR0
RefSeq (мРНК)	NM_001256510 NM_001256511 NM_001256512 NM_001256513 NM_003143	NM_001286663 NM_028358 NM_212468 NM_001364578
RefSeq (білок)	NP_001243439 NP_001243440 NP_001243441 NP_001243442 NP_003134	NP_001273592 NP_082634 NP_997633 NP_001351507
Локус (UCSC)	Хр. 7: 141.74 – 141.79 Mb	Хр. 6: 40.45 – 40.46 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SSBP1 (англ. Single stranded DNA binding protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 148 амінокислот, а молекулярна маса — 17 260.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MFRRPVLQVL		RQFVRHESET		TTSLVLERSL		NRVHLLGRVG		QDPVLRQVEG
KNPVTIFSLA		TNEMWRSGDS		EVYQLGDVSQ		KTTWHRISVF		RPGLRDVAYQ
YVKKGSRIYL		EGKIDYGEYM		DKNNVRRQAT		TIIADNIIFL		SDQTKEKE

A: Аланін
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як реплікація ДНК. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у мітохондрії, мітохондріальному нуклеоїді.

Література

• Tiranti V., Rocchi M., Didonato S., Zeviani M. (1993). Cloning of human and rat cDNAs encoding the mitochondrial single-stranded DNA-binding protein (SSB). Gene. 126: 219—225. PMID 8482537 DOI:10.1016/0378-1119(93)90370-I
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Xu G., Shin S.B., Jaffrey S.R. (2009). Global profiling of protease cleavage sites by chemoselective labeling of protein N-termini. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 106: 19310—19315. PMID 19892738 DOI:10.1073/pnas.0908958106
• Bogenhagen D.F., Rousseau D., Burke S. (2008). The layered structure of human mitochondrial DNA nucleoids. J. Biol. Chem. 283: 3665—3675. PMID 18063578 DOI:10.1074/jbc.M708444200
• van Loon B., Samson L.D. (2013). Alkyladenine DNA glycosylase (AAG) localizes to mitochondria and interacts with mitochondrial single-stranded binding protein (mtSSB). DNA Repair. 12: 177—187. PMID 23290262 DOI:10.1016/j.dnarep.2012.11.009
• Yang C., Curth U., Urbanke C., Kang C. (1997). Crystal structure of human mitochondrial single-stranded DNA binding protein at 2.4-A resolution. Nat. Struct. Biol. 4: 153—157. PMID 9033597 DOI:10.1038/nsb0297-153

Див. також

• Хромосома 7