TFF1

TFF1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1HI7, 1PS2
Ідентифікатори
Символи	TFF1, BCEI, D21S21, HP1.A, HPS2, pNR-2, pS2, trefoil factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 113710 MGI: 88135 HomoloGene: 2426 GeneCards: TFF1
Онтологія гена Молекулярна функція • growth factor activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • міжклітинний простір • extracellular region Біологічний процес • response to immobilization stress • диференціація клітин • response to peptide hormone • maintenance of gastrointestinal epithelium • negative regulation of cell population proliferation • response to iron ion • Загоєння ран • carbohydrate metabolic process • regulation of signaling receptor activity • травлення • GO:0072468 сигнальна трансдукція Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7031	21784
Ensembl	ENSG00000160182	ENSMUSG00000024032
UniProt	P04155	Q08423
RefSeq (мРНК)	NM_003225	NM_009362
RefSeq (білок)	NP_003216	NP_033388
Локус (UCSC)	Хр. 21: 42.36 – 42.37 Mb	Хр. 17: 31.38 – 31.38 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TFF1 (англ. Trefoil factor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 84 амінокислот, а молекулярна маса — 9 150.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATMENKVIC		ALVLVSMLAL		GTLAEAQTET		CTVAPRERQN		CGFPGVTPSQ
CANKGCCFDD		TVRGVPWCFY		PNTIDVPPEE		ECEF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до факторів росту. Секретований назовні.

Література

• Jakowlew S.B., Breathnach R., Jeltsch J.-M., Masiakowski P., Chambon P. (1984). Sequence of the pS2 mRNA induced by estrogen in the human breast cancer cell line MCF-7. Nucleic Acids Res. 12: 2861—2878. PMID 6324130 DOI:10.1093/nar/12.6.2861
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Westley B.R., Griffin S.M., May F.E.B. (2005). Interaction between TFF1, a gastric tumor suppressor trefoil protein, and TFIZ1, a Brichos domain-containing protein with homology to SP-C. Biochemistry. 44: 7967—7975. PMID 15924415 DOI:10.1021/bi047287n
• Mori K., Fujii R., Kida N., Ohta M., Hayashi K. (1988). Identification of a polypeptide secreted by human breast cancer cells (MCF-7) as the human estrogen-responsive gene (pS2) product. Biochem. Biophys. Res. Commun. 155: 366—372. PMID 3261981 DOI:10.1016/S0006-291X(88)81094-5
• Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
• Madsen J., Nielsen O., Tornoe I., Thim L., Holmskov U. (2007). Tissue localization of human trefoil factors 1, 2, and 3. J. Histochem. Cytochem. 55: 505—513. PMID 17242463 DOI:10.1369/jhc.6A7100.2007

Див. також

• Хромосома 21