TNR

TNR
Ідентифікатори
Символи	TNR, TN-R, tenascin R, NEDSTO
Зовнішні ІД	OMIM: 601995 MGI: 99516 HomoloGene: 124416 GeneCards: TNR
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • extracellular region • cell surface • membrane raft • perineuronal net • collagen-containing extracellular matrix • GO:0005578 Позаклітинна матриця • Schaffer collateral - CA1 synapse • glutamatergic synapse Біологічний процес • negative regulation of neuron projection development • positive regulation of synaptic transmission, glutamatergic • extracellular matrix organization • axon guidance • synapse organization • positive regulation of transmission of nerve impulse • neuron cell-cell adhesion • negative regulation of cell-cell adhesion • telencephalon cell migration • negative regulation of axon extension • locomotory exploration behavior • довготривала потенціація • neuromuscular process controlling balance • regulation of neurogenesis • negative regulation of axon extension involved in regeneration • negative regulation of synaptic transmission • modulation of chemical synaptic transmission • associative learning • адгезія клітин Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	7143	21960
Ensembl	ENSG00000116147	ENSMUSG00000015829
UniProt	Q92752	Q8BYI9
RefSeq (мРНК)	NM_003285 NM_001328635	NM_022312
RefSeq (білок)	NP_001315564 NP_003276 NP_003276.3	NP_071707
Локус (UCSC)	Хр. 1: 175.32 – 175.74 Mb	Хр. 1: 159.35 – 159.76 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TNR (англ. Tenascin R) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 358 амінокислот, а молекулярна маса — 149 562.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGADGETVVL		KNMLIGINLI		LLGSMIKPSE		CQLEVTTERV		QRQSVEEEGG
IANYNTSSKE		QPVVFNHVYN		INVPLDNLCS		SGLEASAEQE		VSAEDETLAE
YMGQTSDHES		QVTFTHRINF		PKKACPCASS		AQVLQELLSR		IEMLEREVSV
LRDQCNANCC		QESAATGQLD		YIPHCSGHGN		FSFESCGCIC		NEGWFGKNCS
EPYCPLGCSS		RGVCVDGQCI		CDSEYSGDDC		SELRCPTDCS		SRGLCVDGEC
VCEEPYTGED		CRELRCPGDC		SGKGRCANGT		CLCEEGYVGE		DCGQRQCLNA
CSGRGQCEEG		LCVCEEGYQG		PDCSAVAPPE		DLRVAGISDR		SIELEWDGPM
AVTEYVISYQ		PTALGGLQLQ		QRVPGDWSGV		TITELEPGLT		YNISVYAVIS
NILSLPITAK		VATHLSTPQG		LQFKTITETT		VEVQWEPFSF		SFDGWEISFI
PKNNEGGVIA		QVPSDVTSFN		QTGLKPGEEY		IVNVVALKEQ		ARSPPTSASV
STVIDGPTQI		LVRDVSDTVA		FVEWIPPRAK		VDFILLKYGL		VGGEGGRTTF
RLQPPLSQYS		VQALRPGSRY		EVSVSAVRGT		NESDSATTQF		TTEIDAPKNL
RVGSRTATSL		DLEWDNSEAE		VQEYKVVYST		LAGEQYHEVL		VPRGIGPTTR
ATLTDLVPGT		EYGVGISAVM		NSQQSVPATM		NARTELDSPR		DLMVTASSET
SISLIWTKAS		GPIDHYRITF		TPSSGIASEV		TVPKDRTSYT		LTDLEPGAEY
IISVTAERGR		QQSLESTVDA		FTGFRPISHL		HFSHVTSSSV		NITWSDPSPP
ADRLILNYSP		RDEEEEMMEV		SLDATKRHAV		LMGLQPATEY		IVNLVAVHGT
VTSEPIVGSI		TTGIDPPKDI		TISNVTKDSV		MVSWSPPVAS		FDYYRVSYRP
TQVGRLDSSV		VPNTVTEFTI		TRLNPATEYE		ISLNSVRGRE		ESERICTLVH
TAMDNPVDLI		ATNITPTEAL		LQWKAPVGEV		ENYVIVLTHF		AVAGETILVD
GVSEEFRLVD		LLPSTHYTAT		MYATNGPLTS		GTISTNFSTL		LDPPANLTAS
EVTRQSALIS		WQPPRAEIEN		YVLTYKSTDG		SRKELIVDAE		DTWIRLEGLL
ENTDYTVLLQ		AAQDTTWSSI		TSTAFTTGGR		VFPHPQDCAQ		HLMNGDTLSG
VYPIFLNGEL		SQKLQVYCDM		TTDGGGWIVF		QRRQNGQTDF		FRKWADYRVG
FGNVEDEFWL		GLDNIHRITS		QGRYELRVDM		RDGQEAAFAS		YDRFSVEDSR
NLYKLRIGSY		NGTAGDSLSY		HQGRPFSTED		RDNDVAVTNC		AMSYKGAWWY
KNCHRTNLNG		KYGESRHSQG		INWYHWKGHE		FSIPFVEMKM		RPYNHRLMAG
RKRQSLQF

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з сіаловими кислотами. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Див. також

• Хромосома 1