TNRC18

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
TNRC18
Ідентифікатори
Символи TNRC18, CAGL79, TNRC18A, trinucleotide repeat containing 18
Зовнішні ІД MGI: 3648294 HomoloGene: 45603 GeneCards: TNRC18
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001013722
NM_001080495
NM_001122730
NM_178242
RefSeq (білок)
NP_001073964
NP_001116202
NP_839973
Локус (UCSC) Хр. 7: 5.31 – 5.43 Mb Хр. 5: 142.72 – 142.82 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

TNRC18 (англ. Trinucleotide repeat containing 18) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 968 амінокислот, а молекулярна маса — 314 519[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MDGRDFGPQRSVHGPPPPLLSGLAMDSHRVGAATAGRLPASGLPGPLPPG
KYMAGLNLHPHPGEAFLGSFVASGMGPSASSHGSPVPLPSDLSFRSPTPS
NLPMVQLWAAHAHEGFSHLPSGLYPSYLHLNHLEPPSSGSPLLSQLGQPS
IFDTQKGQGPGGDGFYLPTAGAPGSLHSHAPSARTPGGGHSSGAPAKGSS
SRDGPAKERAGRGGEPPPLFGKKDPRARGEEASGPRGVVDLTQEARAEGR
QDRGPPRLAERLSPFLAESKTKNAALQPSVLTMCNGGAGDVGLPALVAEA
GRGGAKEAARQDEGARLLRRTETLLPGPRPCPSPLPPPPAPPKGPPAPPA
ATPAGVYTVFREQGREHRVVAPTFVPSVEAFDERPGPIQIASQARDARAR
EREAGRPGVLQAPPGSPRPLDRPEGLREKNSVIRSLKRPPPADAPTVRAT
RASPDPRAYVPAKELLKPEADPRPCERAPRGPAGPAAQQAAKLFGLEPGR
PPPTGPEHKWKPFELGNFAATQMAVLAAQHHHSRAEEEAAVVAASSSKKA
YLDPGAVLPRSAATCGRPVADMHSAAHGSGEASAMQSLIKYSGSFARDAV
AVRPGGCGKKSPFGGLGTMKPEPAPTSAGASRAQARLPHSGGPAAGGGRQ
LKRDPERPESAKAFGREGSGAQGEAEVRHPPVGIAVAVARQKDSGGSGRL
GPGLVDQERSLSLSNVKGHGRADEDCVDDRARHREERLLGARLDRDQEKL
LRESKELADLARLHPTSCAPNGLNPNLMVTGGPALAGSGRWSADPAAHLA
THPWLPRSGNASMWLAGHPYGLGPPSLHQGMAPAFPPGLGGSLPSAYQFV
RDPQSGQLVVIPSDHLPHFAELMERATVPPLWPALYPPGRSPLHHAQQLQ
LFSQQHFLRQQEFLYLQQQAAQALELQRSAQLVQERLKAQEHRAEMEEKG
SKRGLEAAGKAGLATAGPGLLPRKPPGLAAGPAGTYGKAVSPPPSPRASP
VAALKAKVIQKLEDVSKPPAYAYPATPSSHPTSPPPASPPPTPGITRKEE
APENVVEKKDLELEKEAPSPFQALFSDIPPRYPFQALPPHYGRPYPFLLQ
PTAAADADGLAPDVPLPADGPERLALSPEDKPIRLSPSKITEPLREGPEE
EPLAEREVKAEVEDMDEGPTELPPLESPLPLPAAEAMATPSPAGGCGGGL
LEAQALSATGQSCAEPSECPDFVEGPEPRVDSPGRTEPCTAALDLGVQLT
PETLVEAKEEPVEVPVAVPVVEAVPEEGLAQVAPSESQPTLEMSDCDVPA
GEGQCPSLEPQEAVPVLGSTCFLEEASSDQFLPSLEDPLAGMNALAAAAE
LPQARPLPSPGAAGAQALEKLEAAESLVLEQSFLHGITLLSEIAELELER
RSQEMGGAERALVARPSLESLLAAGSHMLREVLDGPVVDPLKNLRLPREL
KPNKKYSWMRKKEERMYAMKSSLEDMDALELDFRMRLAEVQRQYKEKQRE
LVKLQRRRDSEDRREEPHRSLARRGPGRPRKRTHAPSALSPPRKRGKSGH
SSGKLSSKSLLTSDDYELGAGIRKRHKGSEEEHDALIGMGKARGRNQTWD
EHEASSDFISQLKIKKKKMASDQEQLASKLDKALSLTKQDKLKSPFKFSD
SAGGKSKTSGGCGRYLTPYDSLLGKNRKALAKGLGLSLKSSREGKHKRAA
KTRKMEVGFKARGQPKSAHSPFASEVSSYSYNTDSEEDEEFLKDEWPAQG
PSSSKLTPSLLCSMVAKNSKAAGGPKLTKRGLAAPRTLKPKPATSRKQPF
CLLLREAEARSSFSDSSEESFDQDESSEEEDEEEELEEEDEASGGGYRLG
ARERALSPGLEESGLGLLARFAASALPSPTVGPSLSVVQLEAKQKARKKE
ERQSLLGTEFEYTDSESEVKVRKRSPAGLLRPKKGLGEPGPSLAAPTPGA
RGPDPSSPDKAKLAVEKGRKARKLRGPKEPGFEAGPEASDDDLWTRRRSE
RIFLHDASAAAPAPVSTAPATKTSRCAKGGPLSPRKDAGRAKDRKDPRKK
KKGKEAGPGAGLPPPRAPALPSEARAPHASSLTAAKRSKAKAKGKEVKKE
NRGKGGAVSKLMESMAAEEDFEPNQDSSFSEDEHLPRGGAVERPLTPAPR
SCIIDKDELKDGLRVLIPMDDKLLYAGHVQTVHSPDIYRVVVEGERGNRP
HIYCLEQLLQEAIIDVRPASTRFLPQGTRIAAYWSQQYRCLYPGTVVRGL
LDLEDDGDLITVEFDDGDTGRIPLSHIRLLPPDYKIQCAEPSPALLVPSA
KRRSRKTSKDTGEGKDGGTAGSEEPGAKARGRGRKPSAKAKGDRAATLEE
GNPTDEVPSTPLALEPSSTPGSKKSPPEPVDKRAKAPKARPAPPQPSPAP
PAFTSCPAPEPFAELPAPATSLAPAPLITMPATRPKPKKARAAEESGAKG
PRRPGEEAELLVKLDHEGVTSPKSKKAKEALLLREDPGAGGWQEPKSLLS
LGSYPPAAGSSEPKAPWPKATDGDLAQEPGPGLTFEDSGNPKSPDKAQAE
QDGAEESESSSSSSSGSSSSSSSSSSSGSETEGEEEGDKNGDGGCGTGGR
NCSAASSRAASPASSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSS
SSSSSSSSSSSSSSSSSSSSSTTDEDSSCSSDDEAAPAPTAGPSAQAALP
TKATKQAGKARPSAHSPGKKTPAPQPQAPPPQPTQPLQPKAQAGAKSRPK
KREGVHLPTTKELAKRQRLPSVENRPKIAAFLPARQLWKWFGKPTQRRGM
KGKARKLFYKAIVRGKEMIRIGDCAVFLSAGRPNLPYIGRIQSMWESWGN
NMVVRVKWFYHPEETSPGKQFHQGQHWDQKSSRSLPAALRVSSQRKDFME
RALYQSSHVDENDVQTVSHKCLVVGLEQYEQMLKTKKYQDSEGLYYLAGT
YEPTTGMIFSTDGVPVLC

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг.

Література

[ред. | ред. код]
  • Nagase T., Nakayama M., Nakajima D., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XX. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 8: 85—95. PMID 11347906 DOI:10.1093/dnares/8.2.85

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11962 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  4. UniProt, O15417 (англ.) . Архів оригіналу за 28 листопада 2016. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]