TRIM15

TRIM15
Ідентифікатори
Символи	TRIM15, RNF93, ZNF178, ZNFB7, tripartite motif containing 15
Зовнішні ІД	MGI: 1916347 HomoloGene: 23819 GeneCards: TRIM15
Онтологія гена Молекулярна функція • zinc ion binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу Клітинна компонента • внутрішньоклітинний Біологічний процес • mesodermal cell fate determination • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • вроджений імунітет • positive regulation of RIG-I signaling pathway • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • positive regulation of type I interferon production • negative regulation of intracellular transport of viral material Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	89870	69097
Ensembl	ENSG00000235960 ENSG00000227147 ENSG00000233599 ENSG00000204610 ENSG00000224145 ENSG00000235905 ENSG00000137384 ENSG00000235259	ENSMUSG00000050747
UniProt	Q9C019	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_033229 NM_052812	NM_001024134 NM_001177872
RefSeq (білок)	NP_150232	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 6: 30.16 – 30.17 Mb	Хр. 17: 37.17 – 37.18 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRIM15 (англ. Tripartite motif containing 15) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 465 амінокислот, а молекулярна маса — 52 113.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPATPSLKVV		HELPACTLCA		GPLEDAVTIP		CGHTFCRLCL		PALSQMGAQS
SGKILLCPLC		QEEEQAETPM		APVPLGPLGE		TYCEEHGEKI		YFFCENDAEF
LCVFCREGPT		HQAHTVGFLD		EAIQPYRDRL		RSRLEALSTE		RDEIEDVKCQ
EDQKLQVLLT		QIESKKHQVE		TAFERLQQEL		EQQRCLLLAR		LRELEQQIWK
ERDEYITKVS		EEVTRLGAQV		KELEEKCQQP		ASELLQDVRV		NQSRCEMKTF
VSPEAISPDL		VKKIRDFHRK		ILTLPEMMRM		FSENLAHHLE		IDSGVITLDP
QTASRSLVLS		EDRKSVRYTR		QKKSLPDSPL		RFDGLPAVLG		FPGFSSGRHR
WQVDLQLGDG		GGCTVGVAGE		GVRRKGEMGL		SAEDGVWAVI		ISHQQCWAST
SPGTDLPLSE		IPRGVRVALD		YEAGQVTLHN		AQTQEPIFTF		TASFSGKVFP
FFAVWKKGSC		LTLKG

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Goei V.L., Parimoo S., Capossela A., Chu T.W., Gruen J.R. (1994). Isolation of novel non-HLA gene fragments from the hemochromatosis region (6p21.3) by cDNA hybridization selection. Am. J. Hum. Genet. 54: 244—251. PMID 8304341

Див. також

• Хромосома 6