TRIM42

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
TRIM42
Ідентифікатори
Символи TRIM42, PPP1R40, T4A1, tripartite motif containing 42
Зовнішні ІД MGI: 1926161 HomoloGene: 12712 GeneCards: TRIM42
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_152616
NM_030219
RefSeq (білок)
NP_689829
NP_084495
Локус (UCSC) Хр. 3: 140.68 – 140.7 Mb Хр. 9: 97.23 – 97.25 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

TRIM42 (англ. Tripartite motif containing 42) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 3-й хромосомі.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 723 амінокислот, а молекулярна маса — 82 745[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
METAMCVCCPCCTWQRCCPQLCSCLCCKFIFTSERNCTCFPCPYKDERNC
QFCHCTCSESPNCHWCCCSWANDPNCKCCCTASSNLNCYYYESRCCRNTI
ITFHKGRLRSIHTSSKTALRTGSSDTQVDEVKSIPANSHLVNHLNCPMCS
RLRLHSFMLPCNHSLCEKCLRQLQKHAEVTENFFILICPVCDRSHCMPYS
NKMQLPENYLHGRLTKRYMQEHGYLKWRFDRSSGPILCQVCRNKRIAYKR
CITCRLNLCNDCLKAFHSDVAMQDHVFVDTSAEEQDEKICIHHPSSRIIE
YCRNDNKLLCTFCKFSFHNGHDTISLIDACSERAASLFSAIAKFKAVRYE
IDNDLMEFNILKNSFKADKEAKRKEIRNGFLKLRSILQEKEKIIMEQIEN
LEVSRQKEIEKYVYVTTMKVNEMDGLIAYSKEALKETGQVAFLQSAKILV
DQIEDGIQTTYRPDPQLRLHSINYVPLDFVELSSAIHELFPTGPKKVRSS
GDSLPSPYPVHSETMIARKVTFSTHSLGNQHIYQRSSSMLSFSNTDKKAK
VGLEACGRAQSATPAKPTDGLYTYWSAGADSQSVQNSSSFHNWYSFNDGS
VKTPGPIVIYQTLVYPRAAKVYWTCPAEDVDSFEMEFYEVITSPPNNVQM
ELCGQIRDIMQQNLELHNLTPNTEYVFKVRAINDNGPGQWSDICKVVTPD
GHGKNRAKWGLLKNIQSALQKHF

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література

[ред. | ред. код]
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Примітки

[ред. | ред. код]
  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:19014 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 18 вересня 2017.
  4. UniProt, Q8IWZ5 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 18 вересня 2017.

Див. також

[ред. | ред. код]