TRMT13

TRMT13
Ідентифікатори
Символи	TRMT13, CCDC76, tRNA methyltransferase 13 homolog
Зовнішні ІД	MGI: 1925219 HomoloGene: 6875 GeneCards: TRMT13
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	54482	229780
Ensembl	ENSG00000122435	ENSMUSG00000033439
UniProt	Q9NUP7	Q8BYH3
RefSeq (мРНК)	NM_019083 NM_001393409 NM_001393410 NM_001393411 NM_001393412 NM_001393413 NM_001393414	NM_030016
RefSeq (білок)	NP_061956	NP_084292
Локус (UCSC)	Хр. 1: 100.13 – 100.15 Mb	Хр. 3: 116.37 – 116.41 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TRMT13 (англ. TRNA methyltransferase 13 homolog) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 481 амінокислот, а молекулярна маса — 54 247.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATSATSPHA		PGFPAEGRCG		YYVEKKKRFC		RMVVAAGKRF		CGEHAGAAEE
EDARKRILCP		LDPKHTVYED		QLAKHLKKCN		SREKPKPDFY		IQDINAGLRD
ETEIPEQLVP		ISSLSEEQLE		KLIKKLRKAS		EGLNSTLKDH		IMSHPALHDA
LNDPKNGDSA		TKHLKQQASI		LGNIENLKLL		GPRRCFVEFG		AGKGKLSHWV
DIALKDAEKV		HFILVEKVTT		RFKVDGKHRK		KNSVFERLQI		DIQHLCLNKI
PVLREEKLPV		VGIGKHLCGM		ATDLALRCLV		ETYAASFEER		NEEPLAKRIK
NDKTEKEIYT		LAKEGNEKNV		PEKWNPVAGI		VIALCCHHRC		DWRHYVGKEY
FRALGLGAVE		FHYFQRMSSW		ATCGMRKTSL		ETSNSTTKRQ		DNQNDDSEEH
DDGGYRITDD		GADCLPGLLS		VEEKKKIGHL		CKLLIDQGRI		QYLQQKGFSP
ALQYYTDPLV		SLENVLLTAL		PNHSSSPETT		A

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, метилтрансфераз. Задіяний у таких біологічних процесах, як процесинг тРНК, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, S-аденозил-L-метіоніном.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Andreeva A., Tidow H. (2008). A novel CHHC Zn-finger domain found in spliceosomal proteins and tRNA modifying enzymes. Bioinformatics. 24: 2277—2280. PMID 18703587 DOI:10.1093/bioinformatics/btn431

Див. також

• Хромосома 1