TTC39A

TTC39A
Ідентифікатори
Символи	TTC39A, C1orf34, DEME-6, Tetratricopeptide Repeat 39A, tetratricopeptide repeat domain 39A
Зовнішні ІД	MGI: 2444350 HomoloGene: 17739 GeneCards: TTC39A
Онтологія гена Молекулярна функція • молекулярна функція Клітинна компонента • компонент клітини Біологічний процес • GO:0022610 життєдіяльність Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	22996	230603
Ensembl	ENSG00000085831	ENSMUSG00000028555
UniProt	Q5SRH9	A2ACP1
RefSeq (мРНК)	NM_001080494 NM_001144832 NM_001297662 NM_001297663 NM_001297664 NM_001297665 NM_001297666 NM_001297667	NM_001145948 NM_153392
RefSeq (білок)	NP_001073963 NP_001138304 NP_001284591 NP_001284592 NP_001284593 NP_001284594 NP_001284595 NP_001284596	NP_001139420 NP_700441
Локус (UCSC)	Хр. 1: 51.29 – 51.35 Mb	Хр. 4: 109.26 – 109.3 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TTC39A (англ. Tetratricopeptide repeat domain 39A) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 613 амінокислот, а молекулярна маса — 69 778.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGQKGHKDSL		YPCGGTPESS		LHEALDQCMT		ALDLFLTNQF		SEALSYLKPR
TKESMYHSLT		YATILEMQAM		MTFDPQDILL		AGNMMKEAQM		LCQRHRRKSS
VTDSFSSLVN		RPTLGQFTEE		EIHAEVCYAE		CLLQRAALTF		LQGSSHGGAV
RPRALHDPSH		ACSCPPGPGR		QHLFLLQDEN		MVSFIKGGIK		VRNSYQTYKE
LDSLVQSSQY		CKGENHPHFE		GGVKLGVGAF		NLTLSMLPTR		ILRLLEFVGF
SGNKDYGLLQ		LEEGASGHSF		RSVLCVMLLL		CYHTFLTFVL		GTGNVNIEEA
EKLLKPYLNR		YPKGAIFLFF		AGRIEVIKGN		IDAAIRRFEE		CCEAQQHWKQ
FHHMCYWELM		WCFTYKGQWK		MSYFYADLLS		KENCWSKATY		IYMKAAYLSM
FGKEDHKPFG		DDEVELFRAV		PGLKLKIAGK		SLPTEKFAIR		KSRRYFSSNP
ISLPVPALEM		MYIWNGYAVI		GKQPKLTDGI		LEIITKAEEM		LEKGPENEYS
VDDECLVKLL		KGLCLKYLGR		VQEAEENFRS		ISANEKKIKY		DHYLIPNALL
ELALLLMEQD		RNEEAIKLLE		SAKQNYKNYS		MESRTHFRIQ		AATLQAKSSL
ENSSRSMVSS		VSL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kuang W.W., Thompson D.A., Hoch R.V., Weigel R.J. (1998). Differential screening and suppression subtractive hybridization identified genes differentially expressed in an estrogen receptor-positive breast carcinoma cell line. Nucleic Acids Res. 26: 1116—1123. PMID 9461476 DOI:10.1093/nar/26.4.1116

Див. також

• Хромосома 1