USP50

USP50
Ідентифікатори
Символи	USP50, ubiquitin specific peptidase 50
Зовнішні ІД	MGI: 1922333 HomoloGene: 75281 GeneCards: USP50
Онтологія гена Молекулярна функція • thiol-dependent deubiquitinase • GO:1904454, GO:1904455, GO:0070138 ubiquitin-like protein-specific protease activity Клітинна компонента • гіалоплазма • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • extrinsic component of plasma membrane • midbody • extrinsic component of endosome membrane • dendritic spine Біологічний процес • ubiquitin-dependent protein catabolic process • protein deubiquitination • endosome organization • Ras protein signal transduction • positive regulation of protein homooligomerization • positive regulation of interleukin-18 production • protein K63-linked deubiquitination • protein K48-linked deubiquitination • positive regulation of NLRP3 inflammasome complex assembly • positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	373509	75083
Ensembl	ENSG00000170236	ENSMUSG00000027364
UniProt	Q70EL3	Q6P8X6
RefSeq (мРНК)	NM_203494	NM_029163
RefSeq (білок)	NP_987090	NP_083439
Локус (UCSC)	Хр. 15: 50.49 – 50.55 Mb	Хр. 2: 126.55 – 126.63 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

USP50 (англ. Ubiquitin specific peptidase 50) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 15-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 339 амінокислот, а молекулярна маса — 38 955.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MTSQPSLPAD		DFDIYHVLAE		CTDYYDTLPV		KEADGNQPHF		QGVTGLWNLG
NTCCVNAISQ		CLCSILPLVE		YFLTGKYITA		LQKFLLPSDC		SEVATAFAYL
MTDMWLGDSD		CVSPEIFWSA		LGNLYPAFTK		KMQQDAQEFL		ICVLNELHEA
LKKYHYSRRR		SYEKGSTQRC		CRKWITTETS		IITQLFEEQL		NYSIVCLKCE
KCTYKNEVFT		VFSLPIPSKY		ECSLRDCLQC		FFQQDALTWN		NEIHCSFCET
KQETAVRASI		SKAPKIIIFH		LKRFDIQGTT		KRKLRTDIHY		PLTNLDLTPY
ICSIFRKYPK		YNLCAVVNHF		GDLDGGHYTA		FCKNSVTQA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг.

Література

• Puente X.S., Lopez-Otin C. (2004). A genomic analysis of rat proteases and protease inhibitors. Genome Res. 14: 609—622. PMID 15060002 DOI:10.1101/gr.1946304

Див. також

• Хромосома 15