ZZEF1

Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
Перейти до навігації Перейти до пошуку
ZZEF1
Ідентифікатори
Символи ZZEF1, ZZZ4, zinc finger ZZ-type and EF-hand domain containing 1
Зовнішні ІД MGI: 2444286 HomoloGene: 9027 GeneCards: ZZEF1
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_015113
NM_001045536
RefSeq (білок)
NP_055928
NP_001039001
Локус (UCSC) Хр. 17: 4 – 4.14 Mb Хр. 11: 72.69 – 72.82 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ZZEF1 (англ. Zinc finger ZZ-type and EF-hand domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 961 амінокислот, а молекулярна маса — 331 075[4].

Послідовність амінокислот
1020304050
MGNAPSHSSEDEAAAAGGEGWGPHQDWAAVSGTTPGPGVAAPALPPAAAL
LEPARLREAAAALLPTPPCESLVSRHRGALFRWLEERLGRGEESVTLEQF
RELLEARGAGCSSEQFEEAFAQFDAEGDGTVDAENMLEALKNSSGANLQG
ELSHIIRQLQACSLVPGFTDIFSESKEGLDIHSSMILRFLHRNRLSSAVM
PYPMLEHCNNMCTMRSSVLKESLDQLVQKEKESPGDLTRSPEMDKLKSVA
KCYAYIETSSNSADIDKMTNGETSSYWQSDGSACSHWIRLKMKPDVVLRH
LSIAVAATDQSYMPQQVTVAVGRNASDLQEVRDVHIPSNVTGYVTLLENA
NVSQLYVQINIKRCLSDGCDTRIHGLRAVGFQRVKKSGVSVSDASAIWYW
SLLTSLVTASMETNPAFVQTVLHNTQKALRHMPPLSLSPGSTDFSTFLSP
NVLEEVDSFLIRITSCCSTPEVELTLLAFALARGSVAKVMSSLCTITDHL
DTQYDASSLILSMASVRQNLLLKYGKPLQLTLQACDVKGKEDKSGPENLL
VEPWTRDGFLTETGKTRASTIFSTGTESAFQVTQIRIMVRRGGIGAQCGL
VFAYNSSSDKFCAEEHFKRFEKYDKWKLQELRQFVKSRIGCSSDDLGEDD
PIGWFELEEEWDEADVKLQQCRVAKYLMVKFLCTRQESAERLGVQGLTIS
GYLRPARAEAEQSVTCAHCRKDTEESVCGATLLLRTLQFIQQLAHDLVQQ
KESGLKYKSFLDFAGLDLQIFWNFYSKLKQNPREECVSAQTLLLQLLQSC
FSVLQGDVLAASEEEKAPIQSPKGVEAAKELYTHLCDVVDKVDGDSVPME
ILKQEVRNTLLNGAAIFFPNRQTRRNHLFTMMNVTEQEHKQSLQLTFRSL
CTYFSDKDPGGLLLLPEKNDLAKMNISEVLAVMDTLVSVAARECELLMLS
GAPGEVGSVLFSLFWSVQGSLLSWCYLQLKSTDSGAKDLAVDLIEKYVGQ
FLASMRAILESLFSQYSGKTIVERLCNSVFSMAARQLVIFLLDFCTLDIP
HCVLLREFSVLTELLKKLCSGPEGGLRKLDVETWQQEQPVVLHTWTKESA
HNYENNCHEVSVFVSPGATYFEVEFDDRCETEKRYDYLEFTDARGRKTRY
DTKVGTDKWPKKVTFKAGPRLQFLFHSDSSHNEWGYKFTVTACGLPDVAV
SWGLDLQLLVSRLMGRLASQCMALKSVRQLGSNMVVPQAKMALVLSSPLW
KPVFRHQVCPELELEASWPTHPHRNSKEVKNIPDDPCRHFLLDFAQSEPA
QNFCGPYSELFKGFIQACRKQAPKTDIVAGSTIDQAVNATFAALVYRTPD
LYEKLQKYVNSGGKIALSEEFAQVYSLADGIRIWMLEMKQKSLMSLGNEA
EEKHSSEATEVNPESLAKECIEKSLLLLKFLPTGISSKESCEKLETADET
SHLQPLNKRQRTSSVVEEHFQASVSPTEAAPPATGDQSPGLGTQPKLPSS
SGLPAADVSPATAEEPLSPSTPTRRPPFTRGRLRLLSFRSMEEARLVPTV
KEKYPVLKDVMDFIKDQSLSHRSVVKVLSLRKAQAQSILEVLKITQHCAE
SLGQPHCFHPPFILFLLELLTCQKDFTNYFGHLEGCGADLHKEIRDTYYQ
LVLFLVKAVKGFSSLNDRSLLPALSCVQTALLHLLDMGWEPNDLAFFVDI
QLPDLLMKMSQENISVHDSVISQWSEEDELADAKQNSEWMDECQDGMFEA
WYEKIAQEDPEKQRKMHMFIARYCDLLNVDISCDGCDEIAPWHRYRCLQC
SDMDLCKTCFLGGVKPEGHGDDHEMVNMEFTCDHCQGLIIGRRMNCNVCD
DFDLCYGCYAAKKYSYGHLPTHSITAHPMVTIRISDRQRLIQPYIHNYSW
LLFAALALYSAHLASAEDVDGEKLDPQTRSSATTLRSQCMQLVGDCLMKA
HQGKGLKALALLGVLPDGDSSLEDQALPVTVPTGASEEQLEKKAVQGAEL
SEAGNGKRAVHEEIRPVDFKQRNKADKGVSLSKDPSCQTQISDSPADASP
PTGLPDAEDSEVSSQKPIEEKAVTPSPEQVFAECSQKRILGLLAAMLPPL
KSGPTVPLIDLEHVLPLMFQVVISNAGHLNETYHLTLGLLGQLIIRLLPA
EVDAAVIKVLSAKHNLFAAGDSSIVPDGWKTTHLLFSLGAVCLDSRVGLD
WACSMAEILRSLNSAPLWRDVIATFTDHCIKQLPFQLKHTNIFTLLVLVG
FPQVLCVGTRCVYMDNANEPHNVIILKHFTEKNRAVIVDVKTRKRKTVKD
YQLVQKGGGQECGDSRAQLSQYSQHFAFIASHLLQSSMDSHCPEAVEATW
VLSLALKGLYKTLKAHGFEEIRATFLQTDLLKLLVKKCSKGTGFSKTWLL
RDLEILSIMLYSSKKEINALAEHGDLELDERGDREEEVERPVSSPGDPEQ
KKLDPLEGLDEPTRICFLMAHDALNAPLHILRAIYELQMKKTDYFFLEVQ
KRFDGDELTTDERIRSLAQRWQPSKSLRLEEQSAKAVDTDMIILPCLSRP
ARCDQATAESNPVTQKLISSTESELQQSYAKQRRSKSAALLHKELNCKSK
RAVRDYLFRVNEATAVLYARHVLASLLAEWPSHVPVSEDILELSGPAHMT
YILDMFMQLEEKHEWEKILQKVLQGCREDMLGTMALAACQFMEEPGMEVQ
VRESKHPYNNNTNFEDKVHIPGAIYLSIKFDSQCNTEEGCDELAMSSSSD
FQQDRHSFSGSQQKWKDFELPGDTLYYRFTSDMSNTEWGYRFTVTAGHLG
RFQTGFEILKQMLSEERVVPHLPLAKIWEWLVGVACRQTGHQRLKAIHLL
LRIVRCCGHSDLCDLALLKPLWQLFTHMEYGLFEDVTQPGILLPLHRALT
ELFFVTENRAQELGVLQDYLLALTTDDHLLRCAAQALQNIAAISLAINYP
NKATRLWNVEC

Кодований геном білок за функціями належить до фосфопротеїнів, ліпопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.

Література[ред. | ред. код]

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
  • Cvekl A. Jr., Zavadil J., Birshtein B.K., Grotzer M.A., Cvekl A. (2004). Analysis of transcripts from 17p13.3 in medulloblastoma suggests ROX/MNT as a potential tumour suppressor gene. Eur. J. Cancer. 40: 2525—2532. PMID 15519529 DOI:10.1016/j.ejca.2004.08.005
  • Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 DOI:10.1038/nbt1240

Примітки[ред. | ред. код]

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:29027 (англ.) . Процитовано 21 вересня 2017.
  4. UniProt, O43149 (англ.) . Архів оригіналу за 6 листопада 2016. Процитовано 21 вересня 2017.

Див. також[ред. | ред. код]