Лактатдегідрогеназа B

Лактатдегідрогеназа B
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1I0Z, 1T2F
Ідентифікатори
Символи	LDHB, HEL-S-281, LDH-B, LDH-H, LDHBD, TRG-5, lactate dehydrogenase B
Зовнішні ІД	OMIM: 150100 MGI: 96763 HomoloGene: 55647 GeneCards: LDHB
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0050229 oxidoreductase activity, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor • oxidoreductase activity • lactate dehydrogenase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • kinase binding • NAD binding • каталітична активність • L-lactate dehydrogenase activity • identical protein binding Клітинна компонента • екзосома • membrane raft • мембрана • myelin sheath • мітохондрія • цитоплазма • гіалоплазма Біологічний процес • NAD metabolic process • lactate metabolic process • carboxylic acid metabolic process • pyruvate metabolic process • carbohydrate metabolic process Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3945	16832
Ensembl	ENSG00000111716	ENSMUSG00000030246
UniProt	P07195	P16125
RefSeq (мРНК)	NM_001174097 NM_002300 NM_001315537	NM_008492 NM_001302765 NM_001316322
RefSeq (білок)	NP_001167568 NP_001302466 NP_002291	NP_001289694 NP_001303251 NP_032518
Локус (UCSC)	Хр. 12: 21.64 – 21.76 Mb	Хр. 6: 142.44 – 142.45 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Лактатдегідрогеназа B (англ. Lactate dehydrogenase B) – білок, який кодується геном LDHB, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 334 амінокислот, а молекулярна маса — 36 638.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MATLKEKLIA		PVAEEEATVP		NNKITVVGVG		QVGMACAISI		LGKSLADELA
LVDVLEDKLK		GEMMDLQHGS		LFLQTPKIVA		DKDYSVTANS		KIVVVTAGVR
QQEGESRLNL		VQRNVNVFKF		IIPQIVKYSP		DCIIIVVSNP		VDILTYVTWK
LSGLPKHRVI		GSGCNLDSAR		FRYLMAEKLG		IHPSSCHGWI		LGEHGDSSVA
VWSGVNVAGV		SLQELNPEMG		TDNDSENWKE		VHKMVVESAY		EVIKLKGYTN
WAIGLSVADL		IESMLKNLSR		IHPVSTMVKG		MYGIENEVFL		SLPCILNARG
LTSVINQKLK		DDEVAQLKKS		ADTLWDIQKD		LKDL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Цей білок за функцією належить до оксидоредуктаз. Білок має сайт для зв'язування з НАД. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• Takeno T., Li S.S.-L. (1989). Structure of the human lactate dehydrogenase B gene. Biochem. J. 257: 921—924. PMID 2930497 DOI:10.1042/bj2570921
• Sakai I., Sharief F.S., Pan Y.-C.E., Li S.S.-L. (1987). The cDNA and protein sequences of human lactate dehydrogenase B. Biochem. J. 248: 933—936. PMID 3435492 DOI:10.1042/bj2480933
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Read J.A., Winter V.J., Eszes C.M., Sessions R.B., Brady R.L. (2001). Structural basis for altered activity of M- and H-isozyme forms of human lactate dehydrogenase. Proteins. 43: 175—185. PMID 11276087 DOI:10.1002/1097-0134(20010501)43:2<175::AID-PROT1029>3.0.CO;2-#
• Shonnard G.C., Hud N.V., Mohrenweiser H.W. (1996). Arginine to tryptophan substitution in the active site of a human lactate dehydrogenase variant -- LDHB GUA1: postulated effects on subunit structure and catalysis. Biochim. Biophys. Acta. 1315: 9—14. PMID 8611651 DOI:10.1016/0925-4439(95)00089-5

Див. також

• Хромосома 12