Альфа-ланцюг фібриногену

Альфа-ланцюг фібриногену
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1BBR, 1DM4, 1FPH, 1FZA, 1FZB, 1FZC, 1FZD, 1FZE, 1FZF, 1FZG, 1LT9, 1LTJ, 1N86, 1N8E, 1RE3, 1RE4, 1RF0, 1RF1, 1YCP, 2A45, 2FFD, 2H43, 2HLO, 2HOD, 2HPC, 2OYH, 2OYI, 2Q9I, 2XNX, 2XNY, 2Z4E, 3AT0, 3BVH, 3E1I, 3GHG, 3H32, 3HUS, 4F27, 5CFA
Ідентифікатори
Символи	FGA, Fib2, fibrinogen alpha chain
Зовнішні ІД	OMIM: 134820 MGI: 1316726 HomoloGene: 428 GeneCards: FGA
Пов'язані генетичні захворювання
familial visceral amyloidosis, Factor I Deficiency, Dysfibrinogenemia
Реагує на сполуку
фібринолізин
Онтологія гена Молекулярна функція • protein-macromolecule adaptor activity • structural molecule activity • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • signaling receptor binding • cell adhesion molecule binding Клітинна компонента • platelet alpha granule • extracellular vesicle • клітинна мембрана • Фібриноген • extracellular region • cell surface • cell cortex • екзосома • platelet alpha granule lumen • external side of plasma membrane • blood microparticle • міжклітинний простір • endoplasmic reticulum lumen Біологічний процес • гемостаз • negative regulation of endothelial cell apoptotic process • positive regulation of peptide hormone secretion • protein polymerization • positive regulation of heterotypic cell-cell adhesion • адаптивна імунна відповідь • Фібриноліз • процес імунної системи • platelet degranulation • зсідання крові • extracellular matrix organization • response to calcium ion • positive regulation of substrate adhesion-dependent cell spreading • blood coagulation, common pathway • negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway via death domain receptors • positive regulation of vasoconstriction • positive regulation of protein secretion • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade • negative regulation of blood coagulation, common pathway • positive regulation of exocytosis • blood coagulation, fibrin clot formation • plasminogen activation • cell-matrix adhesion • вроджений імунітет • platelet aggregation • GO:0072468 сигнальна трансдукція • induction of bacterial agglutination • platelet activation • toll-like receptor signaling pathway • посттрансляційна модифікація Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	2243	14161
Ensembl	ENSG00000171560	ENSMUSG00000028001
UniProt	P02671	E9PV24
RefSeq (мРНК)	NM_000508 NM_021871	NM_001111048 NM_010196
RefSeq (білок)	NP_000499 NP_068657	NP_001104518 NP_034326
Локус (UCSC)	Хр. 4: 154.58 – 154.59 Mb	Хр. 3: 82.93 – 82.94 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Альфа-ланцюг фібриногену (англ. Fibrinogen alpha chain) – білок, який кодується геном FGA, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 866 амінокислот, а молекулярна маса — 94 973.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MFSMRIVCLV		LSVVGTAWTA		DSGEGDFLAE		GGGVRGPRVV		ERHQSACKDS
DWPFCSDEDW		NYKCPSGCRM		KGLIDEVNQD		FTNRINKLKN		SLFEYQKNNK
DSHSLTTNIM		EILRGDFSSA		NNRDNTYNRV		SEDLRSRIEV		LKRKVIEKVQ
HIQLLQKNVR		AQLVDMKRLE		VDIDIKIRSC		RGSCSRALAR		EVDLKDYEDQ
QKQLEQVIAK		DLLPSRDRQH		LPLIKMKPVP		DLVPGNFKSQ		LQKVPPEWKA
LTDMPQMRME		LERPGGNEIT		RGGSTSYGTG		SETESPRNPS		SAGSWNSGSS
GPGSTGNRNP		GSSGTGGTAT		WKPGSSGPGS		TGSWNSGSSG		TGSTGNQNPG
SPRPGSTGTW		NPGSSERGSA		GHWTSESSVS		GSTGQWHSES		GSFRPDSPGS
GNARPNNPDW		GTFEEVSGNV		SPGTRREYHT		EKLVTSKGDK		ELRTGKEKVT
SGSTTTTRRS		CSKTVTKTVI		GPDGHKEVTK		EVVTSEDGSD		CPEAMDLGTL
SGIGTLDGFR		HRHPDEAAFF		DTASTGKTFP		GFFSPMLGEF		VSETESRGSE
SGIFTNTKES		SSHHPGIAEF		PSRGKSSSYS		KQFTSSTSYN		RGDSTFESKS
YKMADEAGSE		ADHEGTHSTK		RGHAKSRPVR		DCDDVLQTHP		SGTQSGIFNI
KLPGSSKIFS		VYCDQETSLG		GWLLIQQRMD		GSLNFNRTWQ		DYKRGFGSLN
DEGEGEFWLG		NDYLHLLTQR		GSVLRVELED		WAGNEAYAEY		HFRVGSEAEG
YALQVSSYEG		TAGDALIEGS		VEEGAEYTSH		NNMQFSTFDR		DADQWEENCA
EVYGGGWWYN		NCQAANLNGI		YYPGGSYDPR		NNSPYEIENG		VVWVSFRGAD
YSLRAVRMKI		RPLVTQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як адаптивний імунітет, зсідання крові, гемостаз, імунітет, вроджений імунітет. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Kant J.A., Lord S.T., Crabtree G.R. (1983). Partial mRNA sequences for human A alpha, B beta, and gamma fibrinogen chains: evolutionary and functional implications. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 80: 3953—3957. PMID 6575389 DOI:10.1073/pnas.80.13.3953
• Rixon M.W., Chan W.-Y., Davie E.W., Chung D.W. (1983). Characterization of a complementary deoxyribonucleic acid coding for the alpha chain of human fibrinogen. Biochemistry. 22: 3237—3244. PMID 6688355 DOI:10.1021/bi00282a031
• Watt K.W.K., Cottrell B.A., Strong D.D., Doolittle R.F. (1979). Amino acid sequence studies on the alpha chain of human fibrinogen. Overlapping sequences providing the complete sequence. Biochemistry. 18: 5410—5416. PMID 518846 DOI:10.1021/bi00591a024
• Imam A.M.A., Eaton M.A.W., Williamson R., Humphries S. (1983). Isolation and characterisation of cDNA clones for the A alpha- and gamma-chains of human fibrinogen. Nucleic Acids Res. 11: 7427—7434. PMID 6689067 DOI:10.1093/nar/11.21.7427
• Chung D.W., Rixon M.W., Que B.G., Davie E.W. (1983). Cloning of fibrinogen genes and their cDNA. Ann. N. Y. Acad. Sci. 408: 449—456. PMID 6575700 DOI:10.1111/j.1749-6632.1983.tb23265.x

Див. також

• Хромосома 4