Гастриксин

PGC
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1AVF, 1HTR
Ідентифікатори
Символи	PGC, PEPC, PGII, gastricsin, progastricsin (pepsinogen C), progastricsin
Зовнішні ІД	OMIM: 169740 MGI: 98909 HomoloGene: 55669 GeneCards: PGC
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0070122 peptidase activity • hydrolase activity • aspartic-type endopeptidase activity Клітинна компонента • extracellular region • міжклітинний простір Біологічний процес • positive regulation of antibacterial peptide production • травлення • GO:0044257 protein catabolic process • протеоліз • автофагія Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5225	109820
Ensembl	ENSG00000096088	ENSMUSG00000023987
UniProt	P20142	Q9D7R7
RefSeq (мРНК)	NM_002630 NM_001166424	NM_025973
RefSeq (білок)	NP_001159896 NP_002621	NP_080249
Локус (UCSC)	Хр. 6: 41.74 – 41.75 Mb	Хр. 17: 48.04 – 48.05 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

PGC (англ. Progastricsin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 388 амінокислот, а молекулярна маса — 42 426.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MKWMVVVLVC		LQLLEAAVVK		VPLKKFKSIR		ETMKEKGLLG		EFLRTHKYDP
AWKYRFGDLS		VTYEPMAYMD		AAYFGEISIG		TPPQNFLVLF		DTGSSNLWVP
SVYCQSQACT		SHSRFNPSES		STYSTNGQTF		SLQYGSGSLT		GFFGYDTLTV
QSIQVPNQEF		GLSENEPGTN		FVYAQFDGIM		GLAYPALSVD		EATTAMQGMV
QEGALTSPVF		SVYLSNQQGS		SGGAVVFGGV		DSSLYTGQIY		WAPVTQELYW
QIGIEEFLIG		GQASGWCSEG		CQAIVDTGTS		LLTVPQQYMS		ALLQATGAQE
DEYGQFLVNC		NSIQNLPSLT		FIINGVEFPL		PPSSYILSNN		GYCTVGVEPT
YLSSQNGQPL		WILGDVFLRS		YYSVYDLGNN		RVGFATAA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, аспартилових протеаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Секретований назовні.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Athauda S.B.P., Tanji M., Kageyama T., Takahashi K. (1989). A comparative study on the NH2-terminal amino acid sequences and some other properties of six isozymic forms of human pepsinogens and pepsins. J. Biochem. 106: 920—927. PMID 2515193 DOI:10.1093/oxfordjournals.jbchem.a122952
• Moore S.A., Sielecki A.R., Chernaia M.M., Tarasova N.I., James M.N.G. (1995). Crystal and molecular structures of human progastricsin at 1.62-A resolution. J. Mol. Biol. 247: 466—485. PMID 7714902 DOI:10.1006/jmbi.1994.0154
• Khan A.R., Cherney M.M., Tarasova N.I., James M.N. (1997). Structural characterization of activation 'intermediate 2' on the pathway to human gastricsin. Nat. Struct. Biol. 4: 1010—1015. PMID 9406551 DOI:10.1038/nsb1297-1010
• Hayano T., Sogawa K., Ichihara Y., Fujii-Kuriyama Y., Takahashi K. (1988). Primary structure of human pepsinogen C gene. J. Biol. Chem. 263: 1382—1385. PMID 3335549
• Foltmann B., Jensen A.L. (1982). Human progastricsin. Analysis of intermediates during activation into gastricsin and determination of the amino acid sequence of the propart. Eur. J. Biochem. 128: 63—70. PMID 6816595

Див. також

• Хромосома 6