Нідоген-1

NID1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1NDX
Ідентифікатори
Символи	NID1, NID, nidogen 1, entactin
Зовнішні ІД	OMIM: 131390 MGI: 97342 HomoloGene: 1878 GeneCards: NID1
Онтологія гена Молекулярна функція • laminin-1 binding • calcium ion binding • laminin binding • collagen binding • extracellular matrix binding • proteoglycan binding • extracellular matrix structural constituent Клітинна компонента • GO:0005578 Позаклітинна матриця • extracellular region • Базальна мембрана • екзосома • cell periphery • міжклітинний простір • collagen-containing extracellular matrix Біологічний процес • cell-matrix adhesion • extracellular matrix disassembly • extracellular matrix organization • адгезія клітин • glomerular basement membrane development • basement membrane organization • positive regulation of cell-substrate adhesion Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	4811	18073
Ensembl	ENSG00000116962	ENSMUSG00000005397
UniProt	P14543	P10493
RefSeq (мРНК)	NM_002508	NM_010917
RefSeq (білок)	NP_002499	NP_035047
Локус (UCSC)	Хр. 1: 235.98 – 236.07 Mb	Хр. 13: 13.61 – 13.69 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NID1 (англ. Nidogen 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 247 амінокислот, а молекулярна маса — 136 377.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MLASSSRIRA		AWTRALLLPL		LLAGPVGCLS		RQELFPFGPG		QGDLELEDGD
DFVSPALELS		GALRFYDRSD		IDAVYVTTNG		IIATSEPPAK		ESHPGLFPPT
FGAVAPFLAD		LDTTDGLGKV		YYREDLSPSI		TQRAAECVHR		GFPEISFQPS
SAVVVTWESV		APYQGPSRDP		DQKGKRNTFQ		AVLASSDSSS		YAIFLYPEDG
LQFHTTFSKK		ENNQVPAVVA		FSQGSVGFLW		KSNGAYNIFA		NDRESVENLA
KSSNSGQQGV		WVFEIGSPAT		TNGVVPADVI		LGTEDGAEYD		DEDEDYDLAT
TRLGLEDVGT		TPFSYKALRR		GGADTYSVPS		VLSPRRAATE		RPLGPPTERT
RSFQLAVETF		HQQHPQVIDV		DEVEETGVVF		SYNTDSRQTC		ANNRHQCSVH
AECRDYATGF		CCSCVAGYTG		NGRQCVAEGS		PQRVNGKVKG		RIFVGSSQVP
IVFENTDLHS		YVVMNHGRSY		TAISTIPETV		GYSLLPLAPV		GGIIGWMFAV
EQDGFKNGFS		ITGGEFTRQA		EVTFVGHPGN		LVIKQRFSGI		DEHGHLTIDT
ELEGRVPQIP		FGSSVHIEPY		TELYHYSTSV		ITSSSTREYT		VTEPERDGAS
PSRIYTYQWR		QTITFQECVH		DDSRPALPST		QQLSVDSVFV		LYNQEEKILR
YALSNSIGPV		REGSPDALQN		PCYIGTHGCD		TNAACRPGPR		TQFTCECSIG
FRGDGRTCYD		IDECSEQPSV		CGSHTICNNH		PGTFRCECVE		GYQFSDEGTC
VAVVDQRPIN		YCETGLHNCD		IPQRAQCIYT		GGSSYTCSCL		PGFSGDGQAC
QDVDECQPSR		CHPDAFCYNT		PGSFTCQCKP		GYQGDGFRCV		PGEVEKTRCQ
HEREHILGAA		GATDPQRPIP		PGLFVPECDA		HGHYAPTQCH		GSTGYCWCVD
RDGREVEGTR		TRPGMTPPCL		STVAPPIHQG		PAVPTAVIPL		PPGTHLLFAQ
TGKIERLPLE		GNTMRKTEAK		AFLHVPAKVI		IGLAFDCVDK		MVYWTDITEP
SIGRASLHGG		EPTTIIRQDL		GSPEGIAVDH		LGRNIFWTDS		NLDRIEVAKL
DGTQRRVLFE		TDLVNPRGIV		TDSVRGNLYW		TDWNRDNPKI		ETSYMDGTNR
RILVQDDLGL		PNGLTFDAFS		SQLCWVDAGT		NRAECLNPSQ		PSRRKALEGL
QYPFAVTSYG		KNLYFTDWKM		NSVVALDLAI		SKETDAFQPH		KQTRLYGITT
ALSQCPQGHN		YCSVNNGGCT		HLCLATPGSR		TCRCPDNTLG		VDCIEQK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як клітинна адгезія. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.

Література

• Zimmermann K., Hoischen S., Hafner M., Nischt R. (1995). Genomic sequences and structural organization of the human nidogen gene (NID). Genomics. 27: 245—250. PMID 7557988 DOI:10.1006/geno.1995.1038
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lee H.K., Seo I.A., Park H.K., Park H.T. (2006). Identification of the basement membrane protein nidogen as a candidate ligand for tumor endothelial marker 7 in vitro and in vivo. FEBS Lett. 580: 2253—2257. PMID 16574105 DOI:10.1016/j.febslet.2006.03.033

Див. також

• Хромосома 1