ARFGEF2

ARFGEF2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3L8N, 3SWV
Ідентифікатори
Символи	ARFGEF2, BIG2, PVNH2, dJ1164I10.1, ADP ribosylation factor guanine nucleotide exchange factor 2
Зовнішні ІД	OMIM: 605371 MGI: 2139354 HomoloGene: 111880 GeneCards: ARFGEF2
Онтологія гена Молекулярна функція • guanyl-nucleotide exchange factor activity • GABA receptor binding • myosin binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein kinase A regulatory subunit binding Клітинна компонента • цитоплазма • recycling endosome • гіалоплазма • ендосома • комплекс Ґольджі • cell projection • мембрана • Golgi membrane • dendritic spine • синапс • центр організації мікротрубочок • міжклітинні контакти • trans-Golgi network • дендрит (нейробіологія) • symmetric synapse • asymmetric synapse • perinuclear region of cytoplasm • цитоскелет • GO:0016023 cytoplasmic vesicle • axonemal microtubule Біологічний процес • endomembrane system organization • GO:0007243 intracellular signal transduction • regulation of ARF protein signal transduction • endosome organization • receptor recycling • positive regulation of tumor necrosis factor production • protein transport • Golgi to plasma membrane transport • екзоцитоз • GO:0015915 транспорт • regulation of molecular function • vesicle-mediated transport Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10564	99371
Ensembl	ENSG00000124198	ENSMUSG00000074582
UniProt	Q9Y6D5	A2A5R2
RefSeq (мРНК)	NM_006420	NM_001085495
RefSeq (білок)	NP_006411	NP_001078964
Локус (UCSC)	Хр. 20: 48.92 – 49.04 Mb	Хр. 2: 166.65 – 166.74 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ARFGEF2 (англ. ADP ribosylation factor guanine nucleotide exchange factor 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 785 амінокислот, а молекулярна маса — 202 038.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MQESQTKSMF		VSRALEKILA		DKEVKRPQHS		QLRRACQVAL		DEIKAEIEKQ
RLGTAAPPKA		NFIEADKYFL		PFELACQSKS		PRVVSTSLDC		LQKLIAYGHI
TGNAPDSGAP		GKRLIDRIVE		TICSCFQGPQ		TDEGVQLQII		KALLTAVTSP
HIEIHEGTIL		QTVRTCYNIY		LASKNLINQT		TAKATLTQML		NVIFTRMENQ
VLQEARELEK		PIQSKPQSPV		IQAAAVSPKF		VRLKHSQAQS		KPTTPEKTDL
TNGEHARSDS		GKVSTENGDA		PRERGSSLSG		TDDGAQEVVK		DILEDVVTSA
IKEAAEKHGL		TEPERVLGEL		ECQECAIPPG		VDENSQTNGI		ADDRQSLSSA
DNLESDAQGH		QVAARFSHVL		QKDAFLVFRS		LCKLSMKPLG		EGPPDPKSHE
LRSKVVSLQL		LLSVLQNAGP		VFRTHEMFIN		AIKQYLCVAL		SKNGVSSVPD
VFELSLAIFL		TLLSNFKMHL		KMQIEVFFKE		IFLNILETST		SSFEHRWMVI
QTLTRICADA		QCVVDIYVNY		DCDLNAANIF		ERLVNDLSKI		AQGRSGHELG
MTPLQELSLR		KKGLECLVSI		LKCMVEWSKD		LYVNPNHQTS		LGQERLTDQE
IGDGKGLDMA		RRCSVTSMES		TVSSGTQTTV		QDDPEQFEVI		KQQKEIIEHG
IELFNKKPKR		GIQFLQEQGM		LGTSVEDIAQ		FLHQEERLDS		TQVGDFLGDS
ARFNKEVMYA		YVDQLDFCEK		EFVSALRTFL		EGFRLPGEAQ		KIDRLMEKFA
ARYIECNQGQ		TLFASADTAY		VLAYSIIMLT		TDLHSPQVKN		KMTKEQYIKM
NRGINDSKDL		PEEYLSSIYE		EIEGKKIAMK		ETKELTIATK		STKQNVASEK
QRRLLYNLEM		EQMAKTAKAL		MEAVSHAKAP		FTSATHLDHV		RPMFKLVWTP
LLAAYSIGLQ		NCDDTEVASL		CLEGIRCAIR		IACIFGMQLE		RDAYVQALAR
FSLLTASSSI		TEMKQKNIDT		IKTLITVAHT		DGNYLGNSWH		EILKCISQLE
LAQLIGTGVK		TRYLSGSGRE		REGSLKGHTL		AGEEFMGLGL		GNLVSGGVDK
RQMASFQESV		GETSSQSVVV		AVDRIFTGST		RLDGNAIVDF		VRWLCAVSMD
ELASPHHPRM		FSLQKIVEIS		YYNMNRIRLQ		WSRIWHVIGD		HFNKVGCNPN
EDVAIFAVDS		LRQLSMKFLE		KGELANFRFQ		KDFLRPFEHI		MKKNRSPTIR
DMAIRCIAQM		VNSQAANIRS		GWKNIFAVFH		QAASDHDGNI		VELAFQTTCH
IVTTIFQHHF		PAAIDSFQDA		VKCLSEFACN		AAFPDTSMEA		IRLIRFCGKY
VSERPRVLQE		YTSDDMNVAP		GDRVWVRGWF		PILFELSCII		NRCKLDVRTR
GLTVMFEIMK		SYGHTFEKHW		WQDLFRIVFR		IFDNMKLPEQ		LSEKSEWMTT
TCNHALYAIC		DVFTQFYEAL		NEVLLSDVFA		QLQWCVKQDN		EQLARSGTNC
LENLVISNGE		KFSPEVWDET		CNCMLDIFKT		TIPHVLLTWR		PVGMEEDSSE
KHLDVDLDRQ		SLSSIDKNPS		ERGQSQLSNP		TDDSWKGRPY		ANQKLFASLL
IKCVVQLELI		QTIDNIVFYP		ATSKKEDAEH		MVAAQQDTLD		ADIHIETEDQ
GMYKYMSSQH		LFKLLDCLQE		SHSFSKAFNS		NYEQRTVLWR		AGFKGKSKPN
LLKQETSSLA		CCLRILFRMY		VDENRRDSWE		EIQQRLLTVC		SEALAYFITV
NSESHREAWT		SLLLLLLTKT		LKINDEKFKA		HASMYYPYLC		EIMQFDLIPE
LRAVLRKFFL		RIGVVYKIWI		PEEPSQVPAA		LSPVW

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, клітинних контактах, клітинних відростках, цитоплазматичних везикулах, апараті гольджі, синапсах, ендосомах.

Література

• Togawa A., Morinaga N., Ogasawara M., Moss J., Vaughan M. (1999). Purification and cloning of a brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein for ADP-ribosylation factors. J. Biol. Chem. 274: 12308—12315. PMID 10212200 DOI:10.1074/jbc.274.18.12308
• Shinotsuka C., Waguri S., Wakasugi M., Uchiyama Y., Nakayama K. (2002). Dominant-negative mutant of BIG2, an ARF-guanine nucleotide exchange factor, specifically affects membrane trafficking from the trans-Golgi network through inhibiting membrane association of AP-1 and GGA coat proteins. Biochem. Biophys. Res. Commun. 294: 254—260. PMID 12051703 DOI:10.1016/S0006-291X(02)00456-4
• Li H., Adamik R., Pacheco-Rodriguez G., Moss J., Vaughan M. (2003). Protein kinase A-anchoring (AKAP) domains in brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2 (BIG2). Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100: 1627—1632. PMID 12571360 DOI:10.1073/pnas.0337678100
• Shin H.W., Morinaga N., Noda M., Nakayama K. (2004). BIG2, a guanine nucleotide exchange factor for ADP-ribosylation factors: its localization to recycling endosomes and implication in the endosome integrity. Mol. Biol. Cell. 15: 5283—5294. PMID 15385626 DOI:10.1091/mbc.E04-05-0388
• Ishizaki R., Shin H.W., Iguchi-Ariga S.M., Ariga H., Nakayama K. (2006). AMY-1 (associate of Myc-1) localization to the trans-Golgi network through interacting with BIG2, a guanine-nucleotide exchange factor for ADP-ribosylation factors. Genes Cells. 11: 949—959. PMID 16866877 DOI:10.1111/j.1365-2443.2006.00991.x
• Kuroda F., Moss J., Vaughan M. (2007). Regulation of brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1 (BIG1) and BIG2 activity via PKA and protein phosphatase 1gamma. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 104: 3201—3206. PMID 17360629 DOI:10.1073/pnas.0611696104

Див. також

• Хромосома 20