CLDN19

CLDN19
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3X29
Ідентифікатори
Символи	CLDN19, HOMG5, claudin 19
Зовнішні ІД	OMIM: 610036 MGI: 3033992 HomoloGene: 17528 GeneCards: CLDN19
Пов'язані генетичні захворювання
renal hypomagnesemia 5 with ocular involvement
Онтологія гена Молекулярна функція • structural molecule activity • identical protein binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • integral component of membrane • міжклітинні контакти • клітинна мембрана • basolateral plasma membrane • apical junction complex • клітинне ядро • bicellular tight junction • мембрана Біологічний процес • calcium-independent cell-cell adhesion via plasma membrane cell-adhesion molecules • apical junction assembly • neuronal action potential propagation • відповідь на стимул • зір • tight junction organization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	149461	242653
Ensembl	ENSG00000164007	ENSMUSG00000066058
UniProt	Q8N6F1	Q9ET38
RefSeq (мРНК)	NM_148960 NM_001123395 NM_001185117	NM_001038590 NM_153105
RefSeq (білок)	NP_001116867 NP_001172046 NP_683763	NP_001033679 NP_694745
Локус (UCSC)	Хр. 1: 42.73 – 42.74 Mb	Хр. 4: 119.11 – 119.12 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CLDN19 (англ. Claudin 19) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 224 амінокислот, а молекулярна маса — 23 229.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MANSGLQLLG		YFLALGGWVG		IIASTALPQW		KQSSYAGDAI		ITAVGLYEGL
WMSCASQSTG		QVQCKLYDSL		LALDGHIQSA		RALMVVAVLL		GFVAMVLSVV
GMKCTRVGDS		NPIAKGRVAI		AGGALFILAG		LCTLTAVSWY		ATLVTQEFFN
PSTPVNARYE		FGPALFVGWA		SAGLAVLGGS		FLCCTCPEPE		RPNSSPQPYR
PGPSAAAREP		VVKLPASAKG		PLGV

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном магнію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, щільних контактах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1