EXOSC5

EXOSC5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2NN6
Ідентифікатори
Символи	EXOSC5, RRP41B, RRP46, Rrp46p, hRrp46p, p12B, Exosome component 5, CABAC
Зовнішні ІД	OMIM: 606492 MGI: 107889 HomoloGene: 5981 GeneCards: EXOSC5
Реагує на сполуку
Viroporin 3a
Онтологія гена Молекулярна функція • 3'-5'-exoribonuclease activity • exoribonuclease activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • Екзосома • nuclear exosome (RNase complex) • cytoplasmic exosome (RNase complex) • ядерце • клітинне ядро • нуклеоплазма Біологічний процес • regulation of mRNA stability • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, exonucleolytic, 3'-5' • rRNA 3'-end processing • rRNA catabolic process • DNA deamination • GO:0071049, GO:0071048, GO:0071033 nuclear mRNA surveillance • defense response to virus • exonucleolytic catabolism of deadenylated mRNA • U4 snRNA 3'-end processing • polyadenylation-dependent snoRNA 3'-end processing • Деградація РНК • rRNA processing • RNA phosphodiester bond hydrolysis, exonucleolytic Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	56915	27998
Ensembl	ENSG00000077348	ENSMUSG00000061286
UniProt	Q9NQT4	Q9CRA8
RefSeq (мРНК)	NM_020158	NM_138586
RefSeq (білок)	NP_064543	NP_613052
Локус (UCSC)	Хр. 19: 41.39 – 41.4 Mb	Хр. 7: 25.36 – 25.37 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

EXOSC5 (англ. Exosome component 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 235 амінокислот, а молекулярна маса — 25 249.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEEETHTDAK		IRAENGTGSS		PRGPGCSLRH		FACEQNLLSR		PDGSASFLQG
DTSVLAGVYG		PAEVKVSKEI		FNKATLEVIL		RPKIGLPGVA		EKSRERLIRN
TCEAVVLGTL		HPRTSITVVL		QVVSDAGSLL		ACCLNAACMA		LVDAGVPMRA
LFCGVACALD		SDGTLVLDPT		SKQEKEARAV		LTFALDSVER		KLLMSSTKGL
YSDTELQQCL		AAAQAASQHV		FRFYRESLQR		RYSKS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як процесинг рРНК. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі, екзосомі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Raijmakers R., Noordman Y.E., van Venrooij W.J., Pruijn G.J.M. (2002). Protein-protein interactions of hCsl4p with other human exosome subunits. J. Mol. Biol. 315: 809—818. PMID 11812149 DOI:10.1006/jmbi.2001.5265
• Guo X., Ma J., Sun J., Gao G. (2007). The zinc-finger antiviral protein recruits the RNA processing exosome to degrade the target mRNA. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 104: 151—156. PMID 17185417 DOI:10.1073/pnas.0607063104
• Chen G., Guo X., Lv F., Xu Y., Gao G. (2008). p72 DEAD box RNA helicase is required for optimal function of the zinc-finger antiviral protein. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 105: 4352—4357. PMID 18334637 DOI:10.1073/pnas.0712276105
• Liu Q., Greimann J.C., Lima C.D. (2006). Reconstitution, activities, and structure of the eukaryotic RNA exosome. Cell. 127: 1223—1237. PMID 17174896 DOI:10.1016/j.cell.2006.10.037
• Liu Q., Greimann J.C., Lima C.D. (2007). Cell. 131: 188—189. {{cite journal}}: Пропущений або порожній |title= (довідка)

Див. також

• Хромосома 19