HLA-DMB

HLA-DMB
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1HDM, 2BC4, 4FQX, 4GBX, 4I0P
Ідентифікатори
Символи	HLA-DMB, D6S221E, RING7, major histocompatibility complex, class II, DM beta
Зовнішні ІД	OMIM: 142856 MGI: 95922 HomoloGene: 68231 GeneCards: HLA-DMB
Онтологія гена Молекулярна функція • MHC class II protein complex binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • lysosomal membrane • лізосома • мембрана • ендосома • late endosome membrane • integral component of membrane • MHC class II protein complex Біологічний процес • positive regulation of T cell activation via T cell receptor contact with antigen bound to MHC molecule on antigen presenting cell • antigen processing and presentation • MHC class II protein complex assembly • positive regulation of T cell proliferation • antigen processing and presentation of peptide or polysaccharide antigen via MHC class II • peptide antigen assembly with MHC class II protein complex • процес імунної системи • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • адаптивна імунна відповідь Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3109	14999
Ensembl	ENSG00000241674 ENSG00000226264 ENSG00000242574 ENSG00000239329 ENSG00000234154 ENSG00000242386 ENSG00000242092 ENSG00000241296	ENSMUSG00000079547
UniProt	P28068	P35737 Q31094
RefSeq (мРНК)	NM_002118	NM_010387
RefSeq (білок)	NP_002109	NP_034517
Локус (UCSC)	Хр. 6: 32.93 – 32.94 Mb	Хр. 17: 34.37 – 34.38 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HLA-DMB (англ. Major histocompatibility complex, class II, DM beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 263 амінокислот, а молекулярна маса — 28 943.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MITFLPLLLG		LSLGCTGAGG		FVAHVESTCL		LDDAGTPKDF		TYCISFNKDL
LTCWDPEENK		MAPCEFGVLN		SLANVLSQHL		NQKDTLMQRL		RNGLQNCATH
TQPFWGSLTN		RTRPPSVQVA		KTTPFNTREP		VMLACYVWGF		YPAEVTITWR
KNGKLVMPHS		SAHKTAQPNG		DWTYQTLSHL		ALTPSYGDTY		TCVVEHIGAP
EPILRDWTPG		LSPMQTLKVS		VSAVTLGLGL		IIFSLGVISW		RRAGHSSYTP
LPGSNYSEGW		HIS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як імунітет. Локалізований у мембрані, лізосомі, ендосомах.

Література

• Kelly A.P., Monaco J.J., Cho S., Trowsdale J. (1991). A new human HLA class II-related locus, DM. Nature. 353: 571—573. PMID 1922365 DOI:10.1038/353571a0
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Sanderson F., Powis S.H., Kelly A.P., Trowsdale J. (1994). Limited polymorphism in HLA-DM does not involve the peptide binding groove. Immunogenetics. 39: 56—58. PMID 8225438 DOI:10.1007/BF00171797
• Carrington M., Yeager M., Mann D. (1993). Characterization of HLA-DMB polymorphism. Immunogenetics. 38: 446—449. PMID 8406617 DOI:10.1007/BF00184526
• Kim T.-G., Carrington M., Choi H.B., Kim H.Y., Han H. (1996). Three HLA-DMB variants in Korean patients with autoimmune diseases. Hum. Immunol. 46: 58—60. PMID 9157091 DOI:10.1016/0198-8859(95)00171-9
• McTernan C.L., Mijovic C.H., Cockram C.S., Barnett A.H. (2000). The nucleotide sequence of a new DMB allele, DMB*0106. Tissue Antigens. 55: 470—472. PMID 10885572 DOI:10.1034/j.1399-0039.2000.550514.x

Див. також

• Хромосома 6