HLA-DOB

HLA-DOB
Наявні структури PDB Пошук для людей: PDBe RCSB Список кодів PDB 4I0P
Ідентифікатори
Символи	HLA-DOB, DOB, major histocompatibility complex, class II, DO beta, HLA_DOB
Зовнішні ІД	OMIM: 600629 MGI: 95925 HomoloGene: 1602 GeneCards: HLA-DOB
Онтологія гена Молекулярна функція • MHC class II receptor activity • MHC class II protein complex binding Клітинна компонента • lysosomal membrane • endosome membrane • лізосома • мембрана • ендосома • integral component of membrane • внутрішньоклітинний • MHC class II protein complex Біологічний процес • negative regulation of antigen processing and presentation of peptide antigen via MHC class II • antigen processing and presentation of peptide or polysaccharide antigen via MHC class II • antigen processing and presentation • процес імунної системи • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • GO:0072468 сигнальна трансдукція • адаптивна імунна відповідь Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3112	15002
Ensembl	ENSG00000243496 ENSG00000241910 ENSG00000243612 ENSG00000239457 ENSG00000241386 ENSG00000241106	ENSMUSG00000041538
UniProt	P13765	н/д
RefSeq (мРНК)	NM_002120	NM_010389
RefSeq (білок)	NP_002111	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 6: 32.81 – 32.82 Mb	Хр. 17: 34.46 – 34.47 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HLA-DOB (англ. Major histocompatibility complex, class II, DO beta) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 273 амінокислот, а молекулярна маса — 30 822.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGSGWVPWVV		ALLVNLTRLD		SSMTQGTDSP		EDFVIQAKAD		CYFTNGTEKV
QFVVRFIFNL		EEYVRFDSDV		GMFVALTKLG		QPDAEQWNSR		LDLLERSRQA
VDGVCRHNYR		LGAPFTVGRK		VQPEVTVYPE		RTPLLHQHNL		LHCSVTGFYP
GDIKIKWFLN		GQEERAGVMS		TGPIRNGDWT		FQTVVMLEMT		PELGHVYTCL
VDHSSLLSPV		SVEWRAQSEY		SWRKMLSGIA		AFLLGLIFLL		VGIVIQLRAQ
KGYVRTQMSG		NEVSRAVLLP		QSC

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як імунітет. Локалізований у мембрані, лізосомі, ендосомах.

Література

• Jonsson A.-K., Rask L. (1989). Human class II DNA and DOB genes display low sequence variability. Immunogenetics. 29: 411—413. PMID 2499532 DOI:10.1007/BF00375872
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Alfonso C., Karlsson L. (2000). Nonclassical MHC class II molecules. Annu. Rev. Immunol. 18: 113—142. PMID 10837054 DOI:10.1146/annurev.immunol.18.1.113
• Tonnelle C., Demars R., Long E.O. (1985). DO beta: a new beta chain gene in HLA-D with a distinct regulation of expression. EMBO J. 4: 2839—2847. PMID 2998758
• Servenius B., Rask L., Peterson P.A. (1987). Class II genes of the human major histocompatibility complex. The DO beta gene is a divergent member of the class II beta gene family. J. Biol. Chem. 262: 8759—8766. PMID 3036827

Див. також

• Хромосома 6