HLA-DRB5

HLA-DRB5
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1FV1, 1H15, 1HQR, 1ZGL
Ідентифікатори
Символи	HLA-DRB5, HLA-DRB, major histocompatibility complex, class II, DR beta 5, HLA-DRB5*
Зовнішні ІД	OMIM: 604776 MGI: 95901 HomoloGene: 101524 GeneCards: HLA-DRB5
Онтологія гена Молекулярна функція • peptide antigen binding Клітинна компонента • integral component of membrane • endocytic vesicle membrane • clathrin-coated endocytic vesicle membrane • ендосома • комплекс Ґольджі • trans-Golgi network membrane • endoplasmic reticulum membrane • мембрана • late endosome membrane • Golgi membrane • клітинна мембрана • transport vesicle membrane • MHC class II protein complex • lysosomal membrane • ендоплазматичний ретикулум • ER to Golgi transport vesicle membrane • лізосома • integral component of lumenal side of endoplasmic reticulum membrane • endosome membrane • екзосома Біологічний процес • antigen processing and presentation • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class II • interferon-gamma-mediated signaling pathway • процес імунної системи • T cell costimulation • antigen processing and presentation of peptide or polysaccharide antigen via MHC class II • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • T cell receptor signaling pathway • адаптивна імунна відповідь Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3127	14969
Ensembl	ENSG00000198502	ENSMUSG00000060586
UniProt	Q30154	P04231 P04230 P18468 P18469 O78196 н/д
RefSeq (мРНК)	NM_002125	NM_010382
RefSeq (білок)	NP_002116	NP_034512
Локус (UCSC)	Хр. 6: 32.52 – 32.53 Mb	Хр. 17: 34.52 – 34.54 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

HLA-DRB5 (англ. Major histocompatibility complex, class II, DR beta 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 266 амінокислот, а молекулярна маса — 30 056.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVCLKLPGGS		YMAKLTVTLM		VLSSPLALAG		DTRPRFLQQD		KYECHFFNGT
ERVRFLHRDI		YNQEEDLRFD		SDVGEYRAVT		ELGRPDAEYW		NSQKDFLEDR
RAAVDTYCRH		NYGVGESFTV		QRRVEPKVTV		YPARTQTLQH		HNLLVCSVNG
FYPGSIEVRW		FRNSQEEKAG		VVSTGLIQNG		DWTFQTLVML		ETVPRSGEVY
TCQVEHPSVT		SPLTVEWRAQ		SESAQSKMLS		GVGGFVLGLL		FLGAGLFIYF
KNQKGHSGLH		PTGLVS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як імунітет. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, ендоплазматичному ретикулумі, лізосомі, апараті гольджі, ендосомах.

Література

• Wu S., Saunders T.L., Bach F.H. (1986). Polymorphism of human Ia antigens generated by reciprocal intergenic exchange between two DR beta loci. Nature. 324: 676—679. PMID 3099214 DOI:10.1038/324676a0
• Lock C.B., So A.K., Welsh K.I., Parkes J.D., Trowsdale J. (1988). MHC class II sequences of an HLA-DR2 narcoleptic. Immunogenetics. 27: 449—455. PMID 3259543 DOI:10.1007/BF00364432
• Demopulos J.T., Hodge T.W., Wooten V., Acton R.T. (1991). A novel DRB1 allele in DR2-positive American blacks. Hum. Immunol. 30: 41—44. PMID 2001975 DOI:10.1016/0198-8859(91)90069-L
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Lee B.S.M., Rust N.A., McMichael A.J., McDevitt H.O. (1987). HLA-DR2 subtypes form an additional supertypic family of DR beta alleles. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 84: 4591—4595. PMID 2885840 DOI:10.1073/pnas.84.13.4591
• Kervaire B., Tiercy J. (1997). Sequence of a new HLA-DR allele, DRB5*0106. Eur. J. Immunogenet. 24: 225—228. PMID 9226128 DOI:10.1111/j.1365-2370.1997.00267.x

Див. також

• Хромосома 6